作者mushroom3969 (xmushroom)
看板Biotech
標題[討論] 有關NGS和real-time pcr的數據
時間Thu Mar 4 22:57:10 2021
我是來自某大學的醫技系學生，想問這裡的各位前輩一個問題
如果今天用a藥物刺激b細胞後，將b細胞拿去給廠商分析NGS後發現有有幾個miRNA和control組的比起來是上升的
那麼我再拿刺激a藥物的b細胞做real-time pcr，那我real-time pcr的miRNA數據也會和NGS的數據一樣是上升的嗎？
先謝謝大家的回答
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1F：推 jabari: 找廠商的specialist 03/04 22:59
2F：→ blence: 大學生送sample給廠商作NGS,是幸還是不幸？ 03/04 23:15
3F：推 lingon: 答案是看狀況 03/05 06:06
4F：推 hwjuranus: 大致上我們會 推測 兩種方法看到的 miRNA 表現趨勢相同 03/05 12:35
5F：→ hwjuranus: 但是如果你想看特定 miRNA 表現量是否都增加很多倍 03/05 12:36
6F：→ hwjuranus: 那就不一定了 方法差異導致 03/05 12:37
7F：推 lelojack: 這個問題可以跟學校的核心設施人員聊阿 03/05 17:42
8F：推 maurice9325: 沒有絕對啦，整個實驗不可見的變因太多，多次確認才 03/07 14:03
9F：→ maurice9325: 可以知道趨勢，但這個趨勢也未必是正確的，所以要多 03/07 14:03
10F：→ maurice9325: 方驗證。同一種藥不同次送，不同人做，甚至廠商不同 03/07 14:03
11F：→ maurice9325: 批次檢測有可能造成不同，所以多做幾次，小心求證。 03/07 14:03
12F：→ joann88431: 我常常結果都不一樣@@ 03/09 13:07
13F：推 lelojack: 表達量高,有生物性重複尤其是動物實驗,ILMN定序 的可重 03/12 11:28
14F：→ lelojack: 複機會高 03/12 11:28
15F：推 evayoyo: 不一定耶~real time PCR驗證出來的結果有時候甚至會相反 03/17 13:49
16F：→ evayoyo: XD所以在篩選candidate 的時候會挑選比較可能真的有差異 03/17 13:49
17F：→ evayoyo: 的，例如有顯著差異且fold change前幾名的，或者是透過p 03/17 13:49
18F：→ evayoyo: aper research 看到有人驗證過相關機制的，這樣會比較容 03/17 13:49
19F：→ evayoyo: 易找到預期中想看的基因 03/17 13:49
20F：推 speeddd: 理論上會上升 實際做出來就不一定了 03/19 11:00