作者mushroom3969 (xmushroom)
看板Biotech
标题[讨论] 有关NGS和real-time pcr的数据
时间Thu Mar 4 22:57:10 2021
我是来自某大学的医技系学生，想问这里的各位前辈一个问题
如果今天用a药物刺激b细胞後，将b细胞拿去给厂商分析NGS後发现有有几个miRNA和control组的比起来是上升的
那麽我再拿刺激a药物的b细胞做real-time pcr，那我real-time pcr的miRNA数据也会和NGS的数据一样是上升的吗？
先谢谢大家的回答
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1F：推 jabari: 找厂商的specialist 03/04 22:59
2F：→ blence: 大学生送sample给厂商作NGS,是幸还是不幸？ 03/04 23:15
3F：推 lingon: 答案是看状况 03/05 06:06
4F：推 hwjuranus: 大致上我们会 推测 两种方法看到的 miRNA 表现趋势相同 03/05 12:35
5F：→ hwjuranus: 但是如果你想看特定 miRNA 表现量是否都增加很多倍 03/05 12:36
6F：→ hwjuranus: 那就不一定了 方法差异导致 03/05 12:37
7F：推 lelojack: 这个问题可以跟学校的核心设施人员聊阿 03/05 17:42
8F：推 maurice9325: 没有绝对啦，整个实验不可见的变因太多，多次确认才 03/07 14:03
9F：→ maurice9325: 可以知道趋势，但这个趋势也未必是正确的，所以要多 03/07 14:03
10F：→ maurice9325: 方验证。同一种药不同次送，不同人做，甚至厂商不同 03/07 14:03
11F：→ maurice9325: 批次检测有可能造成不同，所以多做几次，小心求证。 03/07 14:03
12F：→ joann88431: 我常常结果都不一样@@ 03/09 13:07
13F：推 lelojack: 表达量高,有生物性重复尤其是动物实验,ILMN定序 的可重 03/12 11:28
14F：→ lelojack: 复机会高 03/12 11:28
15F：推 evayoyo: 不一定耶~real time PCR验证出来的结果有时候甚至会相反 03/17 13:49
16F：→ evayoyo: XD所以在筛选candidate 的时候会挑选比较可能真的有差异 03/17 13:49
17F：→ evayoyo: 的，例如有显着差异且fold change前几名的，或者是透过p 03/17 13:49
18F：→ evayoyo: aper research 看到有人验证过相关机制的，这样会比较容 03/17 13:49
19F：→ evayoyo: 易找到预期中想看的基因 03/17 13:49
20F：推 speeddd: 理论上会上升 实际做出来就不一定了 03/19 11:00