作者yayayoyi (drip brew)
看板Biotech
標題[討論] protein-protein interaction能提高活性
時間Thu Oct 17 01:28:49 2019
有點怪，
在我的project中，研究兩個蛋白質的交互作用，
目前確定兩個蛋白質會直接binding
其中一個蛋白質是enzyme,可以測活性，
發現到兩個蛋白質混一起，跟單獨的時候
相同莫爾數下
兩組的活性是有差異的
control都有做好
所以目前data就是這樣，
但我想不到兩個protein在一起如何能增強活性的原因
不知道有沒有什麼例子或references可以提供參考
或是從蛋白質結構上能怎麼解釋？
我的想法是，通常酵素活性增強是有cofacter像是金屬粒子等等的存在
想請問各位前輩的看法
希望能有相關的文獻
我有找到一些但我覺得解釋都不是很清楚
希望能從結構上面提供一些看法
謝謝
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1F：→ a90648: 影響到stability之類的? 10/17 11:18
2F：→ yayayoyi: 的確會影響stability，但可以說因為stability提升而活 10/17 11:37
3F：→ yayayoyi: 性就上升嗎 10/17 11:37
4F：→ a90648: 通常stability提高表示他可以持續作用的時間較長 10/17 14:44
5F：→ a90648: 所以單一的蛋白已經降解了，他還持續在作用 10/17 14:44
6F：→ a90648: 所以stability差異很大的話，那可能就是這個原因 10/17 14:46
7F：→ Ianthegood: 當然可以啊 酵素一定起碼有兩個構型 動作前動作後 中 10/17 14:48
8F：→ Ianthegood: 間通常還有一堆不穩定的狀態 最後會denature stabilit 10/17 14:48
9F：→ Ianthegood: y如果控制的是幾個state之間的equilibrium bulk看起 10/17 14:48
10F：→ Ianthegood: 來就會是活性改變啊 一時想不起來不過phosphorylation 10/17 14:48
11F：→ Ianthegood: 可以找看看例子 10/17 14:48
12F：→ yayayoyi: 我有看到kinase活性因為protein partner加入後活性提高 10/17 15:11
13F：→ yayayoyi: ，但是比較化學的機制還沒找到，我再找找看，謝謝啦 10/17 15:11
14F：推 july81212: 酵素反應包含反應物 的進入 催化反應到產物的排出 都 10/17 20:52
15F：→ july81212: 有相對應的穩定構型有些蛋白平時處於低反應態等到有pr 10/17 20:52
16F：→ july81212: otein partners 結合上去後 活性位會才轉變成適合的fo 10/17 20:52
17F：→ july81212: rm 來反應 10/17 20:52
18F：→ yayayoyi: 我有看到相關的protein partner文獻，但是對於這樣的分 10/18 01:28
19F：→ yayayoyi: 子機制(像是解出enzyme/partner complex結構的，好像沒 10/18 01:28
20F：→ yayayoyi: 找到文獻，請問您有看到相關的嗎？ 10/18 01:28
21F：推 july81212: Cellulose Synthase 或是些膜蛋白大多以subunit 形式 10/18 02:42
22F：→ july81212: 透過PPI來控制反應不過你所謂的機制是要多細就不知道 10/18 02:42
23F：→ july81212: 了 10/18 02:42
24F：→ lucifer74: Allosteric activationPRC2與H3K27me3 10/18 08:34
25F：推 leptoneta: 構型改變使得結合位更容易接上反應物導致速率改變 10/18 09:37
26F：→ leptoneta: 這是常見的調控機轉吧 10/18 09:39
27F：→ yayayoyi: induced fit model通常是在substrate binding時發生， 10/18 10:04
28F：→ yayayoyi: 但我說的是兩個protein binding後，其中一個enzyme活性 10/18 10:04
29F：→ yayayoyi: 提高，我也會往conformational chage想，但我找不到這 10/18 10:04
30F：→ yayayoyi: 樣的文獻 10/18 10:04
31F：推 july81212: 你怎麼卻定你反應時到底是substrate 還是partner誰先 10/18 15:50
32F：→ july81212: 結合呢？ 10/18 15:50
33F：→ yayayoyi: 因為我是把兩個recombinant ptotein純化出來，先證明了 10/19 09:06
34F：→ yayayoyi: 他們真的會binding,然後分別測了enzyme alone及protein 10/19 09:06
35F：→ yayayoyi: complex的活性，substrate是後加的 10/19 09:06
36F：推 skylawer: 先看是km or kcat 改變吧 10/22 16:45
37F：推 skylawer: 還有binding interface 與 catalytics site 的關聯 10/22 16:47
38F：→ skylawer: 光這biochemistry 就可發表了 10/22 16:48