作者yayayoyi (drip brew)
看板Biotech
标题[讨论] protein-protein interaction能提高活性
时间Thu Oct 17 01:28:49 2019
有点怪，
在我的project中，研究两个蛋白质的交互作用，
目前确定两个蛋白质会直接binding
其中一个蛋白质是enzyme,可以测活性，
发现到两个蛋白质混一起，跟单独的时候
相同莫尔数下
两组的活性是有差异的
control都有做好
所以目前data就是这样，
但我想不到两个protein在一起如何能增强活性的原因
不知道有没有什麽例子或references可以提供参考
或是从蛋白质结构上能怎麽解释？
我的想法是，通常酵素活性增强是有cofacter像是金属粒子等等的存在
想请问各位前辈的看法
希望能有相关的文献
我有找到一些但我觉得解释都不是很清楚
希望能从结构上面提供一些看法
谢谢
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 58.114.148.203 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1571246931.A.BB1.html
1F：→ a90648: 影响到stability之类的? 10/17 11:18
2F：→ yayayoyi: 的确会影响stability，但可以说因为stability提升而活 10/17 11:37
3F：→ yayayoyi: 性就上升吗 10/17 11:37
4F：→ a90648: 通常stability提高表示他可以持续作用的时间较长 10/17 14:44
5F：→ a90648: 所以单一的蛋白已经降解了，他还持续在作用 10/17 14:44
6F：→ a90648: 所以stability差异很大的话，那可能就是这个原因 10/17 14:46
7F：→ Ianthegood: 当然可以啊 酵素一定起码有两个构型 动作前动作後 中 10/17 14:48
8F：→ Ianthegood: 间通常还有一堆不稳定的状态 最後会denature stabilit 10/17 14:48
9F：→ Ianthegood: y如果控制的是几个state之间的equilibrium bulk看起 10/17 14:48
10F：→ Ianthegood: 来就会是活性改变啊 一时想不起来不过phosphorylation 10/17 14:48
11F：→ Ianthegood: 可以找看看例子 10/17 14:48
12F：→ yayayoyi: 我有看到kinase活性因为protein partner加入後活性提高 10/17 15:11
13F：→ yayayoyi: ，但是比较化学的机制还没找到，我再找找看，谢谢啦 10/17 15:11
14F：推 july81212: 酵素反应包含反应物 的进入 催化反应到产物的排出 都 10/17 20:52
15F：→ july81212: 有相对应的稳定构型有些蛋白平时处於低反应态等到有pr 10/17 20:52
16F：→ july81212: otein partners 结合上去後 活性位会才转变成适合的fo 10/17 20:52
17F：→ july81212: rm 来反应 10/17 20:52
18F：→ yayayoyi: 我有看到相关的protein partner文献，但是对於这样的分 10/18 01:28
19F：→ yayayoyi: 子机制(像是解出enzyme/partner complex结构的，好像没 10/18 01:28
20F：→ yayayoyi: 找到文献，请问您有看到相关的吗？ 10/18 01:28
21F：推 july81212: Cellulose Synthase 或是些膜蛋白大多以subunit 形式 10/18 02:42
22F：→ july81212: 透过PPI来控制反应不过你所谓的机制是要多细就不知道 10/18 02:42
23F：→ july81212: 了 10/18 02:42
24F：→ lucifer74: Allosteric activationPRC2与H3K27me3 10/18 08:34
25F：推 leptoneta: 构型改变使得结合位更容易接上反应物导致速率改变 10/18 09:37
26F：→ leptoneta: 这是常见的调控机转吧 10/18 09:39
27F：→ yayayoyi: induced fit model通常是在substrate binding时发生， 10/18 10:04
28F：→ yayayoyi: 但我说的是两个protein binding後，其中一个enzyme活性 10/18 10:04
29F：→ yayayoyi: 提高，我也会往conformational chage想，但我找不到这 10/18 10:04
30F：→ yayayoyi: 样的文献 10/18 10:04
31F：推 july81212: 你怎麽却定你反应时到底是substrate 还是partner谁先 10/18 15:50
32F：→ july81212: 结合呢？ 10/18 15:50
33F：→ yayayoyi: 因为我是把两个recombinant ptotein纯化出来，先证明了 10/19 09:06
34F：→ yayayoyi: 他们真的会binding,然後分别测了enzyme alone及protein 10/19 09:06
35F：→ yayayoyi: complex的活性，substrate是後加的 10/19 09:06
36F：推 skylawer: 先看是km or kcat 改变吧 10/22 16:45
37F：推 skylawer: 还有binding interface 与 catalytics site 的关联 10/22 16:47
38F：→ skylawer: 光这biochemistry 就可发表了 10/22 16:48