作者steve42125 (Shiburin)
看板Biotech
標題[求救] 染色Intensity的定量軟體?
時間Tue Aug 6 17:59:16 2019
最近在幫老師處理一批PAS染色的組織切片
透過ImageJ的插件將圖片拆成藍跟紅後可以設定Threshold
順利定量出Positive staining area percentage
但老師希望能夠更進一步地去看Staining intensity
但是不管怎麼google都找不到適合的方法
看到有人說把Mean gray value打開就是mean intensity
但是我後來看了一下定義好像不太對
想知道有什麼方法可以把染色的intensity測出絕對的數值?
因為Glomerulus裡面會有一些空洞
想說能不能圈起一顆glomerulus後，
程式自己讀出這顆glomerulus整體被染色的強度
自然就會排除掉空洞的影響。
真的找不到合適的方法，
希望有經驗的各位可以提供你們使用imageJ的經驗
或著其他軟體我也可以試試看
先謝謝各位了！
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.126.49.54 (臺灣)
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1F：推 loveoldbear: MetaMorgh? 08/06 20:27
剛有稍微查一下，貌似功能滿豐富的
但看起來好像是需要由學校購買授權
這樣現在就沒辦法用了 可惜 但還是謝謝
※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:31:30
※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:37:01
2F：推 tynse71864: 我是想到用 imaris, 但這應該比 metomorph難借到… 08/06 21:56
3F：→ wanderchang: Mean Intensity*Pixel number = Integrated Int. 08/08 18:14