作者steve42125 (Shiburin)
看板Biotech
标题[求救] 染色Intensity的定量软体?
时间Tue Aug 6 17:59:16 2019
最近在帮老师处理一批PAS染色的组织切片
透过ImageJ的插件将图片拆成蓝跟红後可以设定Threshold
顺利定量出Positive staining area percentage
但老师希望能够更进一步地去看Staining intensity
但是不管怎麽google都找不到适合的方法
看到有人说把Mean gray value打开就是mean intensity
但是我後来看了一下定义好像不太对
想知道有什麽方法可以把染色的intensity测出绝对的数值?
因为Glomerulus里面会有一些空洞
想说能不能圈起一颗glomerulus後，
程式自己读出这颗glomerulus整体被染色的强度
自然就会排除掉空洞的影响。
真的找不到合适的方法，
希望有经验的各位可以提供你们使用imageJ的经验
或着其他软体我也可以试试看
先谢谢各位了！
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 120.126.49.54 (台湾)
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1F：推 loveoldbear: MetaMorgh? 08/06 20:27
刚有稍微查一下，貌似功能满丰富的
但看起来好像是需要由学校购买授权
这样现在就没办法用了 可惜 但还是谢谢
※ 编辑: steve42125 (1.161.17.53 台湾), 08/06/2019 20:31:30
※ 编辑: steve42125 (1.161.17.53 台湾), 08/06/2019 20:37:01
2F：推 tynse71864: 我是想到用 imaris, 但这应该比 metomorph难借到… 08/06 21:56
3F：→ wanderchang: Mean Intensity*Pixel number = Integrated Int. 08/08 18:14