作者jeffchu731 (傑斯 siston)
看板Biotech
標題[求救] 打Mass結果判斷
時間Thu Nov 29 04:05:16 2018
各位前輩好，下圖為打Mass後的結果圖，樣品是二維電泳中不確定的點，想請問該如何從
圖中的資訊判定該點為何種蛋白，該參考哪些資訊，非常感謝各位的幫助
https://i.imgur.com/o5XBYar.jpg
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1F：→ Ianthegood: 序列一條一條copy起來去blast啊不然勒 11/29 07:24
2F：→ jeffchu731: 大大，不好意思，小弟門外漢，能否講的詳細一些，感 11/29 08:41
3F：→ jeffchu731: 謝 11/29 08:41
4F：推 lelojack: 你選擇大鼠資料庫，若沒找到結果，可以用 blast 來搜尋 11/29 08:46
5F：→ lelojack: 其他資料庫;blast是序列的google工具 11/29 08:46
6F：→ xxtomnyxx: 這是我第一次看這種報告，如果我搞錯還請指正，這報告 11/29 13:10
7F：→ Anvec: 這應該可信度不低吧 質譜打出的片段 有對到CYTB_RAT 3個位 11/29 13:13
8F：→ Anvec: 置 佔了全部序列的79% 11/29 13:13
9F：→ Anvec: 因為用 Trypsin 切 每段的屁股都是K 11/29 13:14
10F：→ xxtomnyxx: 不就寫了樣本比對結果是 Rat 的 Cystatin B 嗎？ 11/29 13:15
11F：→ Anvec: 啊 5段序列 11/29 13:15
12F：→ xxtomnyxx: 連胺基酸對應到的部份都列給你了耶？下面那些個別的序 11/29 13:16
13F：→ xxtomnyxx: 列就是中間那 Matched peptides shown in Bold Red 中 11/29 13:17
14F：→ xxtomnyxx: 的部份啊 11/29 13:17
15F：推 july81212: 79% coverage應該就是了 不過peptide 沒給斷片資訊第 11/29 17:20
16F：→ july81212: 一次看到@@ 11/29 17:20
17F：推 july81212: Miss 是指trypsin missing cleavage 的peptide 段 11/29 17:25
18F：→ jeffchu731: 好的，十分感謝樓上各位的協助～小弟了解了 11/29 19:31