作者jeffchu731 (杰斯 siston)
看板Biotech
标题[求救] 打Mass结果判断
时间Thu Nov 29 04:05:16 2018
各位前辈好，下图为打Mass後的结果图，样品是二维电泳中不确定的点，想请问该如何从
图中的资讯判定该点为何种蛋白，该参考哪些资讯，非常感谢各位的帮助
https://i.imgur.com/o5XBYar.jpg
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1F：→ Ianthegood: 序列一条一条copy起来去blast啊不然勒 11/29 07:24
2F：→ jeffchu731: 大大，不好意思，小弟门外汉，能否讲的详细一些，感 11/29 08:41
3F：→ jeffchu731: 谢 11/29 08:41
4F：推 lelojack: 你选择大鼠资料库，若没找到结果，可以用 blast 来搜寻 11/29 08:46
5F：→ lelojack: 其他资料库;blast是序列的google工具 11/29 08:46
6F：→ xxtomnyxx: 这是我第一次看这种报告，如果我搞错还请指正，这报告 11/29 13:10
7F：→ Anvec: 这应该可信度不低吧 质谱打出的片段 有对到CYTB_RAT 3个位 11/29 13:13
8F：→ Anvec: 置 占了全部序列的79% 11/29 13:13
9F：→ Anvec: 因为用 Trypsin 切 每段的屁股都是K 11/29 13:14
10F：→ xxtomnyxx: 不就写了样本比对结果是 Rat 的 Cystatin B 吗？ 11/29 13:15
11F：→ Anvec: 啊 5段序列 11/29 13:15
12F：→ xxtomnyxx: 连胺基酸对应到的部份都列给你了耶？下面那些个别的序 11/29 13:16
13F：→ xxtomnyxx: 列就是中间那 Matched peptides shown in Bold Red 中 11/29 13:17
14F：→ xxtomnyxx: 的部份啊 11/29 13:17
15F：推 july81212: 79% coverage应该就是了 不过peptide 没给断片资讯第 11/29 17:20
16F：→ july81212: 一次看到@@ 11/29 17:20
17F：推 july81212: Miss 是指trypsin missing cleavage 的peptide 段 11/29 17:25
18F：→ jeffchu731: 好的，十分感谢楼上各位的协助～小弟了解了 11/29 19:31