作者inake24 (ggbear要提出來是我想的)
看板Biotech
標題[求救] 請問TFBS enrichment analysis是什麼呢
時間Sun Mar 11 12:19:10 2018
看到一篇論文
是把老鼠某組織取出來後
做基因晶片找出該組織裡有表達的基因
並且把這些基因用軟體做分類（clusters)
接著他就做TFBS enrichment analysis
這裡就很不懂了 有自己查過資料
但還是完全沒辦法理解該實驗的目的
是想要看該組織裡的基因他們的關聯性嗎
另外原文裡有說 用1,000 bp sequences upstream of all mouse genes, mouse CpG isl
ands, and the mouse chromosome 19 sequen
三種不同位置的序列做TFBS enrichment analysis
這樣有什麼好處呢
完全是個門外漢
很需要各位幫助QQ
另外想問個白癡問題..
該篇論文的標題有global gene expression
雖然可以意會他的意思
但是在對生資不熟的情況下
不曉得該怎麼用言語來做理解
可以順便請會的大大們
用很白話的方式講解給我嗎
非常謝謝大家！！！
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 220.141.90.97
※ 文章網址: https://webptt.com/m.aspx?n=bbs/Biotech/M.1520741953.A.1F2.html
1F：推 eric2853: Transcription factor binding site, TFBS03/11 16:16
....真感謝==
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 02:58:31
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 02:58:56
2F：→ Godkin: 你是不懂enrichment analysis的意義還是其他部分呢？03/12 03:38
3F：→ Godkin: 你上面提的方法都是拿來檢查基因的共同特性用的03/12 03:42
表面的原理網路上大致都找得到
但是如果有人問我 怎麼做 或是 相關係數怎麼來
我就不行惹
※ 編輯: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 14:11:43
4F：推 Ianthegood: 老實講 你自己沒有要做根本不需要知道原理以外的東西03/12 17:30
人家想知道
※ 編輯: inake24 (42.73.124.84), 03/12/2018 23:36:57
5F：→ Godkin: 我猜你想知道的是怎麼用程式去實做吧？ 03/13 23:29