作者inake24 (ggbear要提出来是我想的)
看板Biotech
标题[求救] 请问TFBS enrichment analysis是什麽呢
时间Sun Mar 11 12:19:10 2018
看到一篇论文
是把老鼠某组织取出来後
做基因晶片找出该组织里有表达的基因
并且把这些基因用软体做分类（clusters)
接着他就做TFBS enrichment analysis
这里就很不懂了 有自己查过资料
但还是完全没办法理解该实验的目的
是想要看该组织里的基因他们的关联性吗
另外原文里有说 用1,000 bp sequences upstream of all mouse genes, mouse CpG isl
ands, and the mouse chromosome 19 sequen
三种不同位置的序列做TFBS enrichment analysis
这样有什麽好处呢
完全是个门外汉
很需要各位帮助QQ
另外想问个白痴问题..
该篇论文的标题有global gene expression
虽然可以意会他的意思
但是在对生资不熟的情况下
不晓得该怎麽用言语来做理解
可以顺便请会的大大们
用很白话的方式讲解给我吗
非常谢谢大家！！！
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※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1520741953.A.1F2.html
1F：推 eric2853: Transcription factor binding site, TFBS03/11 16:16
....真感谢==
※ 编辑: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 02:58:31
※ 编辑: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 02:58:56
2F：→ Godkin: 你是不懂enrichment analysis的意义还是其他部分呢？03/12 03:38
3F：→ Godkin: 你上面提的方法都是拿来检查基因的共同特性用的03/12 03:42
表面的原理网路上大致都找得到
但是如果有人问我 怎麽做 或是 相关系数怎麽来
我就不行惹
※ 编辑: inake24 (1.34.55.79), 03/12/2018 14:11:43
4F：推 Ianthegood: 老实讲 你自己没有要做根本不需要知道原理以外的东西03/12 17:30
人家想知道
※ 编辑: inake24 (42.73.124.84), 03/12/2018 23:36:57
5F：→ Godkin: 我猜你想知道的是怎麽用程式去实做吧？ 03/13 23:29