作者truthPP (就是真理)
看板Biotech
標題[求救] 懇請高手指導Flow的compensation設定
時間Wed Oct 23 20:25:54 2013
各位賢拜好!
想請教一下常做雙染的高手
一些關於compensation的問題
我先簡述一下我的實驗設計
我的實驗本身是在做細胞Autophagocytosis
將一種細胞以apoptosis inducer誘導apoptosis之後
看活的細胞能否將凋亡的同種細胞進行apoptosis
用的大概方法如下
1.將活細胞以PKH67細胞膜染劑(綠螢光)進行染色
2.將欲被吞噬的活細胞或死細胞以PKH26細胞膜染劑(紅螢光)進行染色
3.各別以BSA進行染色反應中止
4.將兩種染好色的細胞混和進行吞噬
5.吞噬反應完成後wash再回溶上Flow以雙染進行測定
其中在實驗組別
在實驗中欲看細胞死亡
是否會造成活細胞autophagocytosis有所增加
因此我以活細胞吞活細胞的組別為control
另設計下列四管用以調整flow設定
1.兩種細胞均不染色
2.活細胞染色(PKH67) 欲被吞噬活細胞不染
3.活細胞不染 欲被吞噬活細胞染色(PKH 26)
4.雙染Control
先上1.調整FSC.SSC.FL1-H.FL2-H至理想設定
之後這些設定就不動了
再分別上2.3調整Compensation
最後再上雙染control看設定有無跑掉
之後就跑各實驗組別
但調整過程中卻發現
3.單染欲被吞噬活細胞染PKH 26這管
(檔案中的第二張圖)
怎麼調Compensation都沒辦法調進FL1-H到10^1以內
但調另一管單染活細胞的compensation(第三張圖)
卻可以很快的將FL2-H調到OK的程度
在不得已的狀況下
在分析時只好把十字往右拉
再來看Double positive(表示細胞有被吞噬)的比例
想請問一下 這樣的狀況要如何調整設定?
很怕這樣定量出來的data不準...
我把實驗的圖檔以下列連結分享
http://ppt.cc/3MhU
另外我也找了一篇也是用這個染劑來做吞噬實驗的paper
讓各位高手來對照他的圖來看我是否有地方沒注意到
paper如下
http://ppt.cc/bvU2
主要是裡面figure 4和6這兩張圖
麻煩各位高手指導
謝謝大家(跪~)
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 120.126.78.86
※ 編輯: truthPP 來自: 120.126.78.86 (10/23 20:38)
※ 編輯: truthPP 來自: 120.126.78.86 (10/23 20:38)
1F:推 tharaohfu:請問你的flow cytometry的機型是? 10/23 20:45
2F:→ truthPP:BD 的Calibur 10/23 20:45
3F:→ truthPP:我有先查過Calibur機型的filter相容性才選這套染劑 10/23 20:47
4F:→ truthPP:如連結無法開啟可用Google chrome的瀏覽器開啟 10/23 20:48
5F:→ galectin:不知道是不是FL1訊號太強,如果FL1&FL2各取log&liner呢? 10/25 10:14