作者truthPP (就是真理)
看板Biotech
标题[求救] 恳请高手指导Flow的compensation设定
时间Wed Oct 23 20:25:54 2013
各位贤拜好!
想请教一下常做双染的高手
一些关於compensation的问题
我先简述一下我的实验设计
我的实验本身是在做细胞Autophagocytosis
将一种细胞以apoptosis inducer诱导apoptosis之後
看活的细胞能否将凋亡的同种细胞进行apoptosis
用的大概方法如下
1.将活细胞以PKH67细胞膜染剂(绿萤光)进行染色
2.将欲被吞噬的活细胞或死细胞以PKH26细胞膜染剂(红萤光)进行染色
3.各别以BSA进行染色反应中止
4.将两种染好色的细胞混和进行吞噬
5.吞噬反应完成後wash再回溶上Flow以双染进行测定
其中在实验组别
在实验中欲看细胞死亡
是否会造成活细胞autophagocytosis有所增加
因此我以活细胞吞活细胞的组别为control
另设计下列四管用以调整flow设定
1.两种细胞均不染色
2.活细胞染色(PKH67) 欲被吞噬活细胞不染
3.活细胞不染 欲被吞噬活细胞染色(PKH 26)
4.双染Control
先上1.调整FSC.SSC.FL1-H.FL2-H至理想设定
之後这些设定就不动了
再分别上2.3调整Compensation
最後再上双染control看设定有无跑掉
之後就跑各实验组别
但调整过程中却发现
3.单染欲被吞噬活细胞染PKH 26这管
(档案中的第二张图)
怎麽调Compensation都没办法调进FL1-H到10^1以内
但调另一管单染活细胞的compensation(第三张图)
却可以很快的将FL2-H调到OK的程度
在不得已的状况下
在分析时只好把十字往右拉
再来看Double positive(表示细胞有被吞噬)的比例
想请问一下 这样的状况要如何调整设定?
很怕这样定量出来的data不准...
我把实验的图档以下列连结分享
http://ppt.cc/3MhU
另外我也找了一篇也是用这个染剂来做吞噬实验的paper
让各位高手来对照他的图来看我是否有地方没注意到
paper如下
http://ppt.cc/bvU2
主要是里面figure 4和6这两张图
麻烦各位高手指导
谢谢大家(跪~)
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 120.126.78.86
※ 编辑: truthPP 来自: 120.126.78.86 (10/23 20:38)
※ 编辑: truthPP 来自: 120.126.78.86 (10/23 20:38)
1F:推 tharaohfu:请问你的flow cytometry的机型是? 10/23 20:45
2F:→ truthPP:BD 的Calibur 10/23 20:45
3F:→ truthPP:我有先查过Calibur机型的filter相容性才选这套染剂 10/23 20:47
4F:→ truthPP:如连结无法开启可用Google chrome的浏览器开启 10/23 20:48
5F:→ galectin:不知道是不是FL1讯号太强,如果FL1&FL2各取log&liner呢? 10/25 10:14