作者Onagraceae (Epilobium)
看板Biotech
標題[求救] 植物抽RNA，沒看到18s跟28s
時間Sun Jun 30 20:42:07 2013
大家好
目前我們實驗室用tri reagent正在抽取植物 (樟科植物，富含醣類的一個類群)RNA
實驗步驟與trizol提供的一致
樣本是較年輕的葉片
但是完成步驟後
看不到18s跟28s rRNA的條帶
樣本的lane也沒什麼smear
但是在相對DNA marker 200-300bps之間，卻有一明顯條帶
看起來就像是5s rRNA的位置?
藥品應該沒有問題
我有嘗試抽取其他醣類比較沒那麼多的物種 (唇形科)
28s 18s跟5s都清楚可見
是因為醣類太多?
或有人有類似的問題否?
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.127.28.78
1F：推 huuban:樣本跟reagent不合，抽植物很常碰到的問題 07/01 14:29
2F：→ huuban:樟科植物尤其難抽，一般kit或reagent無法應付很正常~~ 07/01 14:30
3F：推 batatas:用CTAB抽? 07/02 21:55
4F：→ huuban:CTAB應該可以，也可能還是很難抽就是了 07/02 22:55
5F：→ Onagraceae:我好奇為何只有5s沈澱下來? 07/03 17:49
6F：→ Onagraceae:我試過了，ctab可以抽，不過有很明顯的DNA殘留 07/03 17:50
7F：→ huuban:再放DNase吃乾淨就好了 07/04 11:50
8F：推 WinnieDad:作個RT-PCR一試便知抽RNA結果如何，除非你是要建立cDNA 07/07 12:18
9F：→ WinnieDad:library，如果只是對少數genes有興趣，這種quality測試 07/07 12:21
10F：→ WinnieDad:結果我都只當參考而已。 07/07 12:21