作者Onagraceae (Epilobium)
看板Biotech
标题[求救] 植物抽RNA，没看到18s跟28s
时间Sun Jun 30 20:42:07 2013
大家好
目前我们实验室用tri reagent正在抽取植物 (樟科植物，富含醣类的一个类群)RNA
实验步骤与trizol提供的一致
样本是较年轻的叶片
但是完成步骤後
看不到18s跟28s rRNA的条带
样本的lane也没什麽smear
但是在相对DNA marker 200-300bps之间，却有一明显条带
看起来就像是5s rRNA的位置?
药品应该没有问题
我有尝试抽取其他醣类比较没那麽多的物种 (唇形科)
28s 18s跟5s都清楚可见
是因为醣类太多?
或有人有类似的问题否?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.127.28.78
1F：推 huuban:样本跟reagent不合，抽植物很常碰到的问题 07/01 14:29
2F：→ huuban:樟科植物尤其难抽，一般kit或reagent无法应付很正常~~ 07/01 14:30
3F：推 batatas:用CTAB抽? 07/02 21:55
4F：→ huuban:CTAB应该可以，也可能还是很难抽就是了 07/02 22:55
5F：→ Onagraceae:我好奇为何只有5s沈淀下来? 07/03 17:49
6F：→ Onagraceae:我试过了，ctab可以抽，不过有很明显的DNA残留 07/03 17:50
7F：→ huuban:再放DNase吃乾净就好了 07/04 11:50
8F：推 WinnieDad:作个RT-PCR一试便知抽RNA结果如何，除非你是要建立cDNA 07/07 12:18
9F：→ WinnieDad:library，如果只是对少数genes有兴趣，这种quality测试 07/07 12:21
10F：→ WinnieDad:结果我都只当参考而已。 07/07 12:21