作者judy820107 ()
看板Biotech
標題[求救] 一個普生範圍的PCR問題
時間Thu Jun 27 21:04:43 2013
"如果一個蛋白質有100個胺基酸，
假設在其對應的基因上頭尾各設計一條引子，
以PCR增幅，請問產物大小有哪幾種可能？"
這是嘉義大學去年的大一轉學生考題，
看了很多次還是不明白問題在問什麼。
想說也許對常做實驗的板友會是挺基本的問題，
希望大家看看幫忙，
感恩!!!
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初次發問，請多包涵><
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 123.0.194.113
1F：→ roy047:應該可以簡化成:一個100a.a.的蛋白質其基因長度有幾種可能? 06/27 21:12
2F：→ roy047:考慮intron splicing的話感覺有無限多種耶...@@ 06/27 21:13
3F：→ roy047:題目給的條件太少... 06/27 21:14
4F：推 aceliang:這種題目應該是在沒有alternative splicing的前提下吧= = 06/27 21:35
5F：→ a90648:如果是這樣我看到的都是問長度不是問幾種耶 06/27 22:19
6F：→ judy820107:那請問產物長度是？ 06/27 22:24
7F：→ judy820107:"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次數"嗎？ 06/27 22:26
8F：推 huuban:無限多種吧 xDD 06/27 23:06
9F：推 mesenchymal:那應該回PCR product 大於等於 300 bp 06/27 23:49
10F：→ xxtomnyxx:這題應該是申論題吧...... 06/27 23:57
11F：→ xxtomnyxx:1. 有沒有intron 2. 蛋白質100aa有無包含被切掉的Signal 06/27 23:58
12F：→ xxtomnyxx:peptide? 3. PCR的目的是什麼？ 06/27 23:59
13F：→ xxtomnyxx:然後我覺得應該是≧303，因為要加上stop codon 06/28 00:00
14F：→ judy820107:2.一般講完整的蛋白質產物會包含signal peptide嗎？ 06/28 00:19
15F：→ judy820107:還有，100aa有無包含stop codon對應的aa... 06/28 00:21
16F：→ xxtomnyxx:stop codon不會產生aa，所以100aa的DNA序列絕對不包含 06/28 00:23
17F：→ xxtomnyxx:說完整蛋白質會不會包含signal peptide我就不清楚了... 06/28 00:25
18F：→ a90648:所以才說沒splicing最簡單就是303bp，有的話就無限種囉 06/28 02:23
19F：→ a90648:請問"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次數"是什麼意思? 06/28 02:24
20F：→ judy820107:講錯了>< 是start codon對應的Met 06/28 03:24
21F：→ judy820107:回上方 "兩條DNA有600個核苷酸乘以二的PCR次數為次方" 06/28 03:26
22F：→ judy820107:但計算核苷酸的量應該不對，用bp來回答"產物大小"很好 06/28 03:28
23F：→ judy820107:啊，PCR不用start codon只需要stop codon對吧! 06/28 03:30
24F：→ judy820107:在這整理一下答案喔 "若考慮原本基因之間的intron以及 06/28 03:34
25F：→ judy820107:alternative splicing，PCR產物大小將有無限多種；而若 06/28 03:35
26F：→ judy820107:不考慮intron及alternative splicing(即只考慮coding 06/28 03:37
27F：→ judy820107:sequence)，PCR產物大小為100aa對應的300bp，加上做為 06/28 03:39
28F：→ judy820107:stop codon的3bp，PCR產物大小至少為303bp。" 06/28 03:41
29F：→ judy820107:感謝大家! 有錯還請指教:) 06/28 03:42
30F：→ roy047:嗯..題目說primer設在"頭尾", 如果要辯的話也能說稍往裡面 06/28 08:53
31F：→ roy047:設的話就會比303bp短了, 所以這題真的很不清楚 06/28 08:53
32F：→ roy047:不過大致同意原po推文整理的答案! 06/28 08:54
33F：→ roy047:還有PCR其實start/stop codon都不用考慮 那是轉譯時才用得 06/28 08:56
34F：→ roy047:到, 故在原基因上補回stop codon的3bp 06/28 08:58
35F：→ roy047:PCR就是忠實地把template上的ATCG序列複製放大而已 06/28 08:59
36F：→ roy047:剛想到忘記考慮到5'和3'-UTR...這樣更複雜了@@ 06/28 09:05
37F：→ puec2:爛題目 如果有 alternative splicing怎麼辦 06/28 10:51
38F：→ puec2:不過這種就是很典型的國考題目 想要正確回答就要知道題目的 06/28 10:52
39F：→ puec2:完整條件 然後這個完整條件你要去上某個老師的課才會知道 06/28 10:53
40F：推 jabari:BestANS: 我們都用DNAstar .. 啥? Primer3?? 06/28 14:28
41F：→ oCrazyDucko:3種 06/28 17:51
42F：→ xxtomnyxx:我忽然想到它該不會要問的是 PCR 過程中的產物種類吧... 06/28 22:39
43F：→ xxtomnyxx:這樣就會是 oCD 說的三種：temp+Forwardprimer 06/28 22:40
44F：→ xxtomnyxx:temp+Reverseprimer 還有 forwardprimer+reverseprimer 06/28 22:41
45F：→ xxtomnyxx:夾出來的產物......跟蛋白質多大一點關係都沒有 =_= 06/28 22:41
46F：→ roy047:這樣就不用給100a.a.的資訊了, 且有特別問產物"大小" 06/29 06:04
47F：→ roy047:這樣講的話不如說過程中每elongation1個bp就算1種->?? 06/29 06:07
48F：推 joseph103331:還真的是3種 不過知道這個沒多大意義就是.... 06/29 23:19
49F：→ joseph103331:夾來夾去 還是只要那一種 06/29 23:20
50F：→ roy047:同意...這題比較像整人題 答案太偏頗根本無法說服人 06/30 12:10
51F：→ xxtomnyxx:唉...這種考題竟然出現在大學轉學考，國家前途何在？ 06/30 16:09
52F：推 joseph103331:不過這個問題會出現在template過多而造成smear的原因 06/30 16:19
53F：→ joseph103331:不能說全然無用 但題目這樣簡述只會誤導人而已 06/30 16:20
54F：→ joseph103331:很像是個無用的冷知識 要用在哪搞不好也不知道= = 06/30 16:21