作者judy820107 ()
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标题[求救] 一个普生范围的PCR问题
时间Thu Jun 27 21:04:43 2013
"如果一个蛋白质有100个胺基酸，
假设在其对应的基因上头尾各设计一条引子，
以PCR增幅，请问产物大小有哪几种可能？"
这是嘉义大学去年的大一转学生考题，
看了很多次还是不明白问题在问什麽。
想说也许对常做实验的板友会是挺基本的问题，
希望大家看看帮忙，
感恩!!!
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初次发问，请多包涵><
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 123.0.194.113
1F：→ roy047:应该可以简化成:一个100a.a.的蛋白质其基因长度有几种可能? 06/27 21:12
2F：→ roy047:考虑intron splicing的话感觉有无限多种耶...@@ 06/27 21:13
3F：→ roy047:题目给的条件太少... 06/27 21:14
4F：推 aceliang:这种题目应该是在没有alternative splicing的前提下吧= = 06/27 21:35
5F：→ a90648:如果是这样我看到的都是问长度不是问几种耶 06/27 22:19
6F：→ judy820107:那请问产物长度是？ 06/27 22:24
7F：→ judy820107:"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次数"吗？ 06/27 22:26
8F：推 huuban:无限多种吧 xDD 06/27 23:06
9F：推 mesenchymal:那应该回PCR product 大於等於 300 bp 06/27 23:49
10F：→ xxtomnyxx:这题应该是申论题吧...... 06/27 23:57
11F：→ xxtomnyxx:1. 有没有intron 2. 蛋白质100aa有无包含被切掉的Signal 06/27 23:58
12F：→ xxtomnyxx:peptide? 3. PCR的目的是什麽？ 06/27 23:59
13F：→ xxtomnyxx:然後我觉得应该是≧303，因为要加上stop codon 06/28 00:00
14F：→ judy820107:2.一般讲完整的蛋白质产物会包含signal peptide吗？ 06/28 00:19
15F：→ judy820107:还有，100aa有无包含stop codon对应的aa... 06/28 00:21
16F：→ xxtomnyxx:stop codon不会产生aa，所以100aa的DNA序列绝对不包含 06/28 00:23
17F：→ xxtomnyxx:说完整蛋白质会不会包含signal peptide我就不清楚了... 06/28 00:25
18F：→ a90648:所以才说没splicing最简单就是303bp，有的话就无限种罗 06/28 02:23
19F：→ a90648:请问"600 nucleic acids的DNA*2^PCR次数"是什麽意思? 06/28 02:24
20F：→ judy820107:讲错了>< 是start codon对应的Met 06/28 03:24
21F：→ judy820107:回上方 "两条DNA有600个核苷酸乘以二的PCR次数为次方" 06/28 03:26
22F：→ judy820107:但计算核苷酸的量应该不对，用bp来回答"产物大小"很好 06/28 03:28
23F：→ judy820107:啊，PCR不用start codon只需要stop codon对吧! 06/28 03:30
24F：→ judy820107:在这整理一下答案喔 "若考虑原本基因之间的intron以及 06/28 03:34
25F：→ judy820107:alternative splicing，PCR产物大小将有无限多种；而若 06/28 03:35
26F：→ judy820107:不考虑intron及alternative splicing(即只考虑coding 06/28 03:37
27F：→ judy820107:sequence)，PCR产物大小为100aa对应的300bp，加上做为 06/28 03:39
28F：→ judy820107:stop codon的3bp，PCR产物大小至少为303bp。" 06/28 03:41
29F：→ judy820107:感谢大家! 有错还请指教:) 06/28 03:42
30F：→ roy047:嗯..题目说primer设在"头尾", 如果要辩的话也能说稍往里面 06/28 08:53
31F：→ roy047:设的话就会比303bp短了, 所以这题真的很不清楚 06/28 08:53
32F：→ roy047:不过大致同意原po推文整理的答案! 06/28 08:54
33F：→ roy047:还有PCR其实start/stop codon都不用考虑 那是转译时才用得 06/28 08:56
34F：→ roy047:到, 故在原基因上补回stop codon的3bp 06/28 08:58
35F：→ roy047:PCR就是忠实地把template上的ATCG序列复制放大而已 06/28 08:59
36F：→ roy047:刚想到忘记考虑到5'和3'-UTR...这样更复杂了@@ 06/28 09:05
37F：→ puec2:烂题目 如果有 alternative splicing怎麽办 06/28 10:51
38F：→ puec2:不过这种就是很典型的国考题目 想要正确回答就要知道题目的 06/28 10:52
39F：→ puec2:完整条件 然後这个完整条件你要去上某个老师的课才会知道 06/28 10:53
40F：推 jabari:BestANS: 我们都用DNAstar .. 啥? Primer3?? 06/28 14:28
41F：→ oCrazyDucko:3种 06/28 17:51
42F：→ xxtomnyxx:我忽然想到它该不会要问的是 PCR 过程中的产物种类吧... 06/28 22:39
43F：→ xxtomnyxx:这样就会是 oCD 说的三种：temp+Forwardprimer 06/28 22:40
44F：→ xxtomnyxx:temp+Reverseprimer 还有 forwardprimer+reverseprimer 06/28 22:41
45F：→ xxtomnyxx:夹出来的产物......跟蛋白质多大一点关系都没有 =_= 06/28 22:41
46F：→ roy047:这样就不用给100a.a.的资讯了, 且有特别问产物"大小" 06/29 06:04
47F：→ roy047:这样讲的话不如说过程中每elongation1个bp就算1种->?? 06/29 06:07
48F：推 joseph103331:还真的是3种 不过知道这个没多大意义就是.... 06/29 23:19
49F：→ joseph103331:夹来夹去 还是只要那一种 06/29 23:20
50F：→ roy047:同意...这题比较像整人题 答案太偏颇根本无法说服人 06/30 12:10
51F：→ xxtomnyxx:唉...这种考题竟然出现在大学转学考，国家前途何在？ 06/30 16:09
52F：推 joseph103331:不过这个问题会出现在template过多而造成smear的原因 06/30 16:19
53F：→ joseph103331:不能说全然无用 但题目这样简述只会误导人而已 06/30 16:20
54F：→ joseph103331:很像是个无用的冷知识 要用在哪搞不好也不知道= = 06/30 16:21