作者kemmy (Ocean Deep)
看板Biotech
標題Re: [討論] Phospmimic目的?
時間Tue Jun 5 08:41:45 2012
※ 引述《whitesteven (白小熊)》之銘言：
: 小弟在看paper時，遇到了不太了解的問題
: 主要是關於TF(轉錄調節因子，IRF3)的問題
: 此paper提到受病毒感染後，引發receptor辨認，傳遞訊號給下游轉入因子，
: 此轉錄因子3'端之Serine rich區被磷酸化，引發此轉錄因子活化，
: 進而translocation進核內，引發免疫基因的表現。
: 然後作者利用不同處理要來看此調節因子的特性，
: 做了一個方法：將3'Serine 突變成Aspartic acid，再來看此轉錄因子的表現量
: 結果發現突變後的結果表現量比控制組高。
: 在網路上只到說將S突變成D的理由是因為他們兩個胺基酸較像，
: 所以選擇突變成D較好。
: 不過我看了結構上感覺phosphserine 跟Aspartic acid相似度還好
: 想問說將S突變成D的目的是什麼？ 突變成其他的好像就不叫phosphmimic了
: 不太懂其差別。
: 也有看到寫說D帶負電，跟磷酸化後帶電相同
: ↑ 所以是這樣就可以讓轉錄因子活化嗎?
: 煩請大家了。
其實就只是單純的 1. D 與 phospho-S 支鏈都帶負電, 2. 支鏈長度相似 (都是
-CH2-......)。所以在你這個 case, D mutant 就是一個 constitutively active
mutant。
不過這種突變 (S to D) 不見得都會 work, 通常是死馬當活馬醫, 有 work
算你賺到。
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◆ From: 69.143.218.248
1F：→ blence:S通常也要考慮變成A或L,來證明D的p-mimic不是恰巧 06/05 09:53
2F：推 whitesteven: 因為此轉錄因子需透過磷酸化才能活化進核內 06/05 12:12
3F：→ whitesteven:所以mimin的方式是可以讓他持續活化的意思嗎? 06/05 12:13
4F：推 joseph103331:沒錯 可觀察這個位置的磷酸化是否為功能性相關 06/05 22:14