作者kemmy (Ocean Deep)
看板Biotech
标题Re: [讨论] Phospmimic目的?
时间Tue Jun 5 08:41:45 2012
※ 引述《whitesteven (白小熊)》之铭言：
: 小弟在看paper时，遇到了不太了解的问题
: 主要是关於TF(转录调节因子，IRF3)的问题
: 此paper提到受病毒感染後，引发receptor辨认，传递讯号给下游转入因子，
: 此转录因子3'端之Serine rich区被磷酸化，引发此转录因子活化，
: 进而translocation进核内，引发免疫基因的表现。
: 然後作者利用不同处理要来看此调节因子的特性，
: 做了一个方法：将3'Serine 突变成Aspartic acid，再来看此转录因子的表现量
: 结果发现突变後的结果表现量比控制组高。
: 在网路上只到说将S突变成D的理由是因为他们两个胺基酸较像，
: 所以选择突变成D较好。
: 不过我看了结构上感觉phosphserine 跟Aspartic acid相似度还好
: 想问说将S突变成D的目的是什麽？ 突变成其他的好像就不叫phosphmimic了
: 不太懂其差别。
: 也有看到写说D带负电，跟磷酸化後带电相同
: ↑ 所以是这样就可以让转录因子活化吗?
: 烦请大家了。
其实就只是单纯的 1. D 与 phospho-S 支链都带负电, 2. 支链长度相似 (都是
-CH2-......)。所以在你这个 case, D mutant 就是一个 constitutively active
mutant。
不过这种突变 (S to D) 不见得都会 work, 通常是死马当活马医, 有 work
算你赚到。
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◆ From: 69.143.218.248
1F：→ blence:S通常也要考虑变成A或L,来证明D的p-mimic不是恰巧 06/05 09:53
2F：推 whitesteven: 因为此转录因子需透过磷酸化才能活化进核内 06/05 12:12
3F：→ whitesteven:所以mimin的方式是可以让他持续活化的意思吗? 06/05 12:13
4F：推 joseph103331:没错 可观察这个位置的磷酸化是否为功能性相关 06/05 22:14