作者mzac1b (Goodday)
看板Biotech
標題[求救] 關於primer 設計與區別物種基因的問題
時間Wed Feb 15 15:48:30 2012
發問時請注意，若是要問實驗相關的問題，請將實驗的步驟、所用的條件大致列出
以方便板友幫您追蹤問題
----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章----
比如某基因的兩物種cDNA 如下
在某段末端有一個差異
V
human 5'....GACCCCTTCATTGACCTCAACTAC...3'
|||||||||||||||||||||||
mouse 5'....GACCCCTTCATTGACCTCAACTAT...3'
如果針對該差異設計針對human的引子
5'-GACCCCTTCATTGACCTCAACTAC-3'
而另一端也用同樣概念使用引子末端的差異
這樣設計單一base的差異
是否能用來進行PCR 以區別物種的cDNA?
按理說那個末端base由於在mouse cDNA
match不到於是 extend無法進行
自然無法進行PCR
是這樣嗎?
想問是否這樣就足以設計物種專一的primer?
或這本來就是常用的方法?
又或者有其他設計的方法?
先感謝分享指教~~
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 210.60.122.200
1F：推 qqmango:只差一個bp太小了吧，感覺還是P得出來XD 02/15 20:36
2F：推 kingbar:我認為理論上是可行的，而且我去GOOGLE到有人這麼做過耶~ 02/15 20:51
3F：→ kingbar:PCR Methods for Identification of Point Mutations and 02/15 20:52
4F：→ kingbar:Gene Rearrangements (Springer Protocals) 02/15 20:53
5F：→ WinnieDad:理論上來說3'最末端的差異會讓polymerase無法extend and 02/15 21:11
6F：→ WinnieDad:synthesize新股的DNA strand，但實際情況可能就非得實驗 02/15 21:12
7F：→ WinnieDad:才能求證了。 02/15 21:12