作者mzac1b (Goodday)
看板Biotech
标题[求救] 关於primer 设计与区别物种基因的问题
时间Wed Feb 15 15:48:30 2012
发问时请注意，若是要问实验相关的问题，请将实验的步骤、所用的条件大致列出
以方便板友帮您追踪问题
----请将上列注意事项以 ctrl + k 删除後开始编辑文章----
比如某基因的两物种cDNA 如下
在某段末端有一个差异
V
human 5'....GACCCCTTCATTGACCTCAACTAC...3'
|||||||||||||||||||||||
mouse 5'....GACCCCTTCATTGACCTCAACTAT...3'
如果针对该差异设计针对human的引子
5'-GACCCCTTCATTGACCTCAACTAC-3'
而另一端也用同样概念使用引子末端的差异
这样设计单一base的差异
是否能用来进行PCR 以区别物种的cDNA?
按理说那个末端base由於在mouse cDNA
match不到於是 extend无法进行
自然无法进行PCR
是这样吗?
想问是否这样就足以设计物种专一的primer?
或这本来就是常用的方法?
又或者有其他设计的方法?
先感谢分享指教~~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 210.60.122.200
1F：推 qqmango:只差一个bp太小了吧，感觉还是P得出来XD 02/15 20:36
2F：推 kingbar:我认为理论上是可行的，而且我去GOOGLE到有人这麽做过耶~ 02/15 20:51
3F：→ kingbar:PCR Methods for Identification of Point Mutations and 02/15 20:52
4F：→ kingbar:Gene Rearrangements (Springer Protocals) 02/15 20:53
5F：→ WinnieDad:理论上来说3'最末端的差异会让polymerase无法extend and 02/15 21:11
6F：→ WinnieDad:synthesize新股的DNA strand，但实际情况可能就非得实验 02/15 21:12
7F：→ WinnieDad:才能求证了。 02/15 21:12