作者rockerwei (才女)
看板Biotech
標題Re: [求救] 用舊的agarose gel跑RNA
時間Sat Nov 12 00:16:26 2011
※ 引述《pocession (阿宗)》之銘言:
: ※ 引述《rockerwei (才女)》之銘言:
: : 不過我們實驗室也只有用DNA maker來看18s和28s是不是對的
: : DNA maker跑得很正常
: : (RNA有特別的maker嗎?)
: : 我們的膠只是單純放在一般的保鮮盒
: : buffer已經跑到都要不行了
: : 所以還是要用全新的膠全新的buffer來跑會比較好就對了
: : (因為實驗室check PCR pruduct也都是用舊得膠舊的buffer跑~但band都很正常)
: : 因為在以前的實驗室都是要跑才做膠所以RNA也都是正常的
: : (而且還有先denature處理過才跑,做的膠有外加ATA)
: : 所以不確定是因為跑舊膠的問題還是沒有經過denature的處理
: : (現在的實驗室有點窮,所以都沒有處理RNA就直接跑了~)
: 嗯 可能我的意思讓你有點誤解
: 要跑RNA Marker的原因有兩個
: 一個是DNA的分子量沒有辦法代表RNA (DNA為雙股,RNA為單股,單體的分子量也不一樣)
: 另一個是確保你在SAMPLE prepare或是跑膠的過程中RNA沒有分解
: (如果跑膠的流程中出錯,RNA marker就會分解了,以此作為判斷)
: 所以你用DNA marker作比較,是沒辦法作任何判斷的
: 另外,根據我的經驗,膠的新鮮與否並不是很直接的影響
: 主要是跟你放置的容器和跑膠的buffer有很大的關係
: 容器要乾淨,跑膠的buffer儘量滅過菌,然後要跑時再稀釋(要用二次水),
: 如果要把RNA sample作變性處理
: 可以自己配製含formaldehyde的loading buffer就好了,滿便宜的
: 如果不想買RNA marker,可以自己用acid phenol抽新鮮的大腸桿菌(養至對數期的細菌)
: 裡面會有5S, 16S, 23S;可以幫助你判斷位置和跑膠流程有沒有發生問題
再求救一次~我這次已經用新的buffer跑了~可是還是沒有18S和28S的band
我在想是不是配膠的問題
因為我是直接拿DNA的agarose gel來跑
請問大大們
有沒有配RNA gel 的配方~~
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◆ From: 220.137.13.140
1F:推 f9361046:不是那個問題.. 11/12 01:04
2F:推 Realthugz:etbr gel要看到band是沒問題的.... 11/12 09:10
3F:推 huuban:degrade掉了嗎?有沒有smear? 還是連smear都沒有? 11/12 13:45
4F:→ huuban:請問你現在到底是怎麼跑膠的呢? 11/12 13:49
5F:→ huuban:是什麼樣本?確定操作過程都OK嗎? 11/12 13:51