作者atung1988 (巴豆妖)
看板Biotech
標題[討論] 求救高手解答microsatellite typing analysis
時間Sat Oct 1 04:11:28 2011
最近看了一篇期刊
當中用 microsatellite typing analysis的方式去偵測NPC細胞的deletion現象
他應該是要告訴我們在NPC中,發生DELETION是常見的現象
結果如圖:
http://ppt.cc/fqgy
這個方式的原理好像也是利用PCR的方式
而結果中圖的縱軸應該是螢光物質、橫軸似乎是Allele號碼但不確定
那我想請問一下如何看這張圖了解CNE1和C666是homozygous而NP69和NP460是
heterozygous呢?
並且CNE1和C666雖然都是homozygous,但是他的橫軸位置好像不一樣?
請高手幫忙解答一下,謝
ps:CNE1和C666都是NPC Cell line
NP69和NP460都是NP Cell line
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 123.194.52.213
1F：推 williamyang:其實就是homozygosity mapping.若是連續出現 10/01 08:30
2F：→ williamyang:homozygous的genotye,代表該區域極有可能產生缺失. 10/01 08:31
3F：推 captdavince:這個是用兩種taqman probe去做的吧~兩種螢光label 10/01 09:57
4F：→ atung1988:那我想請問一下橫軸是什麼@@?另外CNE和C666雖然都是HOMO 10/01 12:46
5F：→ atung1988:但是他的橫軸位置不一樣...是不是有什麼不一樣?? 10/01 12:46
6F：→ atung1988:畢竟都是homo也有可能有兩個allele都沒有被deletion跟 10/01 12:47
7F：→ atung1988:皆有被deletion 10/01 12:47
8F：→ williamyang:因為micosatellite的allele很多,會連續出現homozygous 10/01 12:51
9F：→ williamyang:的機率就不會很大,因此看到連續出現,就可能有deletion 10/01 12:52
10F：→ williamyang:還有都是deletion的話,不會有genotype出來 10/01 12:55
11F：→ atung1988:恩恩~~可是這樣我只了解左邊的圖的意思!!那請問一下右邊 10/01 13:05
12F：→ atung1988:圖要怎麼看呀!!CNE和C666橫軸不一樣的原因是?? 10/01 13:06
13F：→ atung1988:又為什麼heterozygous就會有兩個peak@@? 10/01 13:06
14F：→ atung1988:不好意思喔@@一直麻煩你qq 10/01 13:07
15F：→ williamyang:你應該先了解什麼是microsatellite marker,就會知道 10/01 13:14
16F：→ williamyang:為何heterozygous會有2個peaks 10/01 13:15