作者atung1988 (巴豆妖)
看板Biotech
标题[讨论] 求救高手解答microsatellite typing analysis
时间Sat Oct 1 04:11:28 2011
最近看了一篇期刊
当中用 microsatellite typing analysis的方式去侦测NPC细胞的deletion现象
他应该是要告诉我们在NPC中,发生DELETION是常见的现象
结果如图:
http://ppt.cc/fqgy
这个方式的原理好像也是利用PCR的方式
而结果中图的纵轴应该是萤光物质、横轴似乎是Allele号码但不确定
那我想请问一下如何看这张图了解CNE1和C666是homozygous而NP69和NP460是
heterozygous呢?
并且CNE1和C666虽然都是homozygous,但是他的横轴位置好像不一样?
请高手帮忙解答一下,谢
ps:CNE1和C666都是NPC Cell line
NP69和NP460都是NP Cell line
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◆ From: 123.194.52.213
1F：推 williamyang:其实就是homozygosity mapping.若是连续出现 10/01 08:30
2F：→ williamyang:homozygous的genotye,代表该区域极有可能产生缺失. 10/01 08:31
3F：推 captdavince:这个是用两种taqman probe去做的吧~两种萤光label 10/01 09:57
4F：→ atung1988:那我想请问一下横轴是什麽@@?另外CNE和C666虽然都是HOMO 10/01 12:46
5F：→ atung1988:但是他的横轴位置不一样...是不是有什麽不一样?? 10/01 12:46
6F：→ atung1988:毕竟都是homo也有可能有两个allele都没有被deletion跟 10/01 12:47
7F：→ atung1988:皆有被deletion 10/01 12:47
8F：→ williamyang:因为micosatellite的allele很多,会连续出现homozygous 10/01 12:51
9F：→ williamyang:的机率就不会很大,因此看到连续出现,就可能有deletion 10/01 12:52
10F：→ williamyang:还有都是deletion的话,不会有genotype出来 10/01 12:55
11F：→ atung1988:恩恩~~可是这样我只了解左边的图的意思!!那请问一下右边 10/01 13:05
12F：→ atung1988:图要怎麽看呀!!CNE和C666横轴不一样的原因是?? 10/01 13:06
13F：→ atung1988:又为什麽heterozygous就会有两个peak@@? 10/01 13:06
14F：→ atung1988:不好意思喔@@一直麻烦你qq 10/01 13:07
15F：→ williamyang:你应该先了解什麽是microsatellite marker,就会知道 10/01 13:14
16F：→ williamyang:为何heterozygous会有2个peaks 10/01 13:15