作者akongapple (Mr. Kang)
看板Biotech
標題[求救] His-tagged protein 純化方法
時間Thu Aug 18 13:53:47 2011
我使用的column是Sartobind IDA 75
欲純化的protein為His-tagged EGFP protein,6xhis-tag接在EGFP的C-ter.
用2xLB medium養菌並且induce後抽取cell lysates的上清液,上清液呈現明顯的綠色
用藍光激發後可觀察到明顯的綠色螢光
因此我想純化出存在上清液中的EGFP protein
Sartobind IDA的原理是利用iminodiacetic acid來chelate二價離子再利用二價離子去抓
histidine
我使用的buffer分別如下:
Equilibration buffer (100 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, pH4.5)
Charging buffer (0.5 M NiSO4 in ddH2O)
Washing buffer (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 20 mM imidazole, pH8)
Elution buffer 1 (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 250 mM imidazole, pH8)
Elution buffer 2 (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 500 mM imidazole, pH8)
以上buffer均先過0.22 um filter
Loading的順序如下:
10 mL ddH2O -> 10 mL Equilibration buffer -> 10 mL Charging buffer ->
10 mL Equilibration buffer -> 10 mL ddH2O -> 10 mL Washing buffer ->
5 mL sample -> 10 mL Washing buffer(每 1 mL 收一個fraction)
-> 5 mL Elution buffer 1 -> 5 mL Elution buffer 2 (每 1 mL 收一個fraction)
結果如下:
Sample flow-through 的濾液呈現明顯綠色,藍光激發後有明顯的綠色螢光
Washing fraction #1-#3 用Nanodrop spectrophotometer測A280有吸收值
藍光激發後有綠色螢光,其餘則在A280的吸收值很低且無綠色螢光
Elution fraction A280的吸收值全部很低並且全無綠色螢光
請教一下各位大大
這樣的方法哪裡有瑕疵嗎
基本上完全是依照user manual的protocol
可是從結果看來,EGFP protein應該是完全沒有被Ni2+抓住
雖然尚未做Western blot來確認
但從A280的值看來Elute出來的fraction幾乎是沒有protein的存在
麻煩各位了
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.121.98
1F:→ TOTO:你的loading順序有點怪,但我好奇的是你的sample是lysate嗎? 08/19 03:20
2F:→ TOTO:lysis buffer成分跟條件是什麼?另外elution buffer ph值也高 08/19 03:21
3F:→ akongapple:sample是bacterial lysates離心後的上清液 08/20 10:44
4F:→ akongapple:lysis buffer是20mM NaH2PO4和20mM K2HPO4 pH7.2 08/20 10:44
5F:推 huhu126:Eqilibration buffer的pH值似乎有點低,通常很少看到使用 08/21 09:07
6F:→ huhu126:酸性的starting buffer,中性會比較好吧... 08/21 09:08
7F:推 babysiter:Equilibration buffer 我用的是7.4 08/21 19:10