小弟最近在研究gene marker 看到很多看似很淺但是確又很重要，讓我似懂非懂的詞 SNP,單一何甘酸多型性,指的是基因序列中,單一何甘酸的變異。 Genotyping,Genotype, 名詞:基因型,指的是基因的序列,型態!甚至是膠片上的片段pattern! 動詞:表示透過各種的實驗方式包含RFLP,RAPD,SNP等方法，了解基因的序列或型態!! Gene marker:基因分子標誌，指的是一個DNA片段，其位於染色體上，此片段可大可小， 小至SNP(僅有一個NT的差異)，甚至是一整個片段的不同； 其功用在於區分細胞個體或是物種。其操作的形式也很多種包含:RFLP,AFLP, RAPD,SSR,SNP,RAD marker等。 Question 1:以上，我想請教到底這三個怎麼串在一起阿? Answer:是說:gene marker的方式可以幫助人們了解genotype嗎? 而SNP，或是其他SSR,RFLP,AFLP等,都是幫助genotyping的方法! 我這樣說對嗎? Question 2:那這樣跟gene mapping有什麼差異?? 我也看到了解這些可以幫助了解和疾病(或phenotype)和基因型間的關係 像是GWAS(genome-wide-association-study) 我知道大多數的SNP和及並有關係!但是我們要怎麼知道呢? High-throughput-screening的技術發達，我們可以很快的解序, 但是我們還是不容易明瞭序列的功能以及其與疾病(表型)!! Question 3:我這樣說對嗎?我們拿到那麼多的SNP或是marker後， 我們要怎麼作後續的動作? Question 4:我也有問一位美國的教授,他說現在的解序技術太發達了! 我們可以很快的解序，但是如果要排列序列就很花時間! 請問通常都要做什麼實驗才可以知道其排列的位置? 我知道有透過"recombination rate"估算位置，以及物理性位置(Physical Mapping) 而吉隆米克斯最近推出的next-generation-sequencing,速度快 但基因片段重組,也是一個重要課題。 這位教授建議我:乾脆把需要的物種全部解序,這樣你就可以得到很多資訊了!! 你擁有這些需列資料,你也就有很多的東西可以玩了!!你也可以從中找到你想切入的方向! 以上是我最近閱讀的心得與感想，希望板上的大大先進 給予一些建議或是有用的文章!!幫助我了解更多!! 我有說錯的地方,也請不吝賜教,謝謝!! --

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