小弟最近在研究gene marker 看到很多看似很浅但是确又很重要，让我似懂非懂的词 SNP,单一何甘酸多型性,指的是基因序列中,单一何甘酸的变异。 Genotyping,Genotype, 名词:基因型,指的是基因的序列,型态!甚至是胶片上的片段pattern! 动词:表示透过各种的实验方式包含RFLP,RAPD,SNP等方法，了解基因的序列或型态!! Gene marker:基因分子标志，指的是一个DNA片段，其位於染色体上，此片段可大可小， 小至SNP(仅有一个NT的差异)，甚至是一整个片段的不同； 其功用在於区分细胞个体或是物种。其操作的形式也很多种包含:RFLP,AFLP, RAPD,SSR,SNP,RAD marker等。 Question 1:以上，我想请教到底这三个怎麽串在一起阿? Answer:是说:gene marker的方式可以帮助人们了解genotype吗? 而SNP，或是其他SSR,RFLP,AFLP等,都是帮助genotyping的方法! 我这样说对吗? Question 2:那这样跟gene mapping有什麽差异?? 我也看到了解这些可以帮助了解和疾病(或phenotype)和基因型间的关系 像是GWAS(genome-wide-association-study) 我知道大多数的SNP和及并有关系!但是我们要怎麽知道呢? High-throughput-screening的技术发达，我们可以很快的解序, 但是我们还是不容易明了序列的功能以及其与疾病(表型)!! Question 3:我这样说对吗?我们拿到那麽多的SNP或是marker後， 我们要怎麽作後续的动作? Question 4:我也有问一位美国的教授,他说现在的解序技术太发达了! 我们可以很快的解序，但是如果要排列序列就很花时间! 请问通常都要做什麽实验才可以知道其排列的位置? 我知道有透过"recombination rate"估算位置，以及物理性位置(Physical Mapping) 而吉隆米克斯最近推出的next-generation-sequencing,速度快 但基因片段重组,也是一个重要课题。 这位教授建议我:乾脆把需要的物种全部解序,这样你就可以得到很多资讯了!! 你拥有这些需列资料,你也就有很多的东西可以玩了!!你也可以从中找到你想切入的方向! 以上是我最近阅读的心得与感想，希望板上的大大先进 给予一些建议或是有用的文章!!帮助我了解更多!! 我有说错的地方,也请不吝赐教,谢谢!! --

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