12634 篇有回應 關於調取水稻基因的方法 後來我有寄信給原 po 說明整個調取過程 但是我一直覺得這是個笨方法耶 XD 因為本身不是做這個的, 只是曾經有興趣亂按亂按摸出一點心得 不知道有沒有高手提供更好的建議? 可以更快更簡潔調到自己想到的片段 Q Q 以下是我的方法~ 先至 NCBI 找出基因 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/9271397 裡面有一項 mRNA and Protein(s) 看下面那行~ NM_001185723.1 → NP_001172652.1 Os01g0847800 [Oryza sativa Japonica Group] 其中 NP_001172652.1 這項可以連結到他的序列 就按進去會出現 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001172652.1 最下面有顯示胺基酸的序列 但你要點的是上面的 CDS CDS 點進去後最下方會有核酸序列出現 把這段核酸序列複製起來 貼到下面網址的 nucleotide blast 中做比對 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi nucleotide blast 一點進去裡面會有大框框 序列要貼在裡面, 中間有 Choose Search Set , 原本有預設 Human genomic + transcript 把它改成後面的 other 最後左下角有 BLAST 按下去就會開始比對 接下來會看到一項 Query 1 ATGGCCACCCACTTCACGCTCAACACCGGAGCACGCATCCCCTCGGTGGGCCTCGGCACC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63375 ATGGCCACCCACTTCACGCTCAACACCGGAGCACGCATCCCCTCGGTGGGCCTCGGCACC 63434 Query 61 TACAAGGCCGGCACCGGCGTCGTCGCCGACGTGGTCTCCGCCGCCGTCAAGG 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63435 TACAAGGCCGGCACCGGCGTCGTCGCCGACGTGGTCTCCGCCGCCGTCAAGG 63486 1~112 是你剛輸入的序列 63375~63486 是此基因在染色體上的位子 上面有一項 dbj|AP004127.1 點進去 出現 Oryza sativa Japonica Group genomic DNA, chromosome 1, clone:P0005H10 你就知道剛剛你搜尋的基因位於水稻染色體上第一條 畫面最下方會有這條染色體的序列 而且有標示位子 你就把 63375~63486 之前的序列找出來就行了~ ※ 編輯: ganbaol 來自: 120.126.57.51 (03/24 18:38)