12634 篇有回应 关於调取水稻基因的方法 後来我有寄信给原 po 说明整个调取过程 但是我一直觉得这是个笨方法耶 XD 因为本身不是做这个的, 只是曾经有兴趣乱按乱按摸出一点心得 不知道有没有高手提供更好的建议? 可以更快更简洁调到自己想到的片段 Q Q 以下是我的方法~ 先至 NCBI 找出基因 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/9271397 里面有一项 mRNA and Protein(s) 看下面那行~ NM_001185723.1 → NP_001172652.1 Os01g0847800 [Oryza sativa Japonica Group] 其中 NP_001172652.1 这项可以连结到他的序列 就按进去会出现 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001172652.1 最下面有显示胺基酸的序列 但你要点的是上面的 CDS CDS 点进去後最下方会有核酸序列出现 把这段核酸序列复制起来 贴到下面网址的 nucleotide blast 中做比对 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi nucleotide blast 一点进去里面会有大框框 序列要贴在里面, 中间有 Choose Search Set , 原本有预设 Human genomic + transcript 把它改成後面的 other 最後左下角有 BLAST 按下去就会开始比对 接下来会看到一项 Query 1 ATGGCCACCCACTTCACGCTCAACACCGGAGCACGCATCCCCTCGGTGGGCCTCGGCACC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63375 ATGGCCACCCACTTCACGCTCAACACCGGAGCACGCATCCCCTCGGTGGGCCTCGGCACC 63434 Query 61 TACAAGGCCGGCACCGGCGTCGTCGCCGACGTGGTCTCCGCCGCCGTCAAGG 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63435 TACAAGGCCGGCACCGGCGTCGTCGCCGACGTGGTCTCCGCCGCCGTCAAGG 63486 1~112 是你刚输入的序列 63375~63486 是此基因在染色体上的位子 上面有一项 dbj|AP004127.1 点进去 出现 Oryza sativa Japonica Group genomic DNA, chromosome 1, clone:P0005H10 你就知道刚刚你搜寻的基因位於水稻染色体上第一条 画面最下方会有这条染色体的序列 而且有标示位子 你就把 63375~63486 之前的序列找出来就行了~ ※ 编辑: ganbaol 来自: 120.126.57.51 (03/24 18:38)