作者WinnieDad (小熊維尼的天才老爹)
看板Biotech
標題[問題] 請教一個關於intron loss的問題
時間Tue Feb 15 11:22:42 2011
※ [本文轉錄自 Biology 看板 #1DMV5WU4 ]
作者: WinnieDad (小熊維尼的天才老爹) 看板: Biology
標題: [問題] 請教一個關於intron loss的問題
時間: Tue Feb 15 11:22:06 2011
【問題】：已定序的intron loss event，可否僅是PCR時amplified到被轉譯的基因
片段，而非真正的lost intron
【問題起因】：小弟於研究中發現到幾個intron loss events並且得到該intron完全
切除的定序結果，為之興奮不已。但是有教授質疑此結果可能是我做
PCR時複製到剛好已完成轉譯的片段。
【個人看法】：由於整個DNA extraction過程中都有小心做RNase處理，理論上應該
不會發生轉譯完成的mRNA存在又被RT成cDNA後在PCR時增幅。另外；
跑膠的結果也都只有單一條cDNA size的band而已，如果是教授所說
的情況發生，應該會看到原本的基因片段和無intron的片段兩條bands
同時存在。我用以上這兩點解釋時是蠻有信心的，可是教授一直在奸
笑，笑的我心發寒…
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.16.202
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1F：→ hal:多設計幾組primer驗證 比如跨intron或是跨exon的primer 02/15 13:07
2F：→ WinnieDad:我的primers本身就是依附exons而跨intron(s)的。 02/15 13:25