作者WinnieDad (小熊维尼的天才老爹)
看板Biotech
标题[问题] 请教一个关於intron loss的问题
时间Tue Feb 15 11:22:42 2011
※ [本文转录自 Biology 看板 #1DMV5WU4 ]
作者: WinnieDad (小熊维尼的天才老爹) 看板: Biology
标题: [问题] 请教一个关於intron loss的问题
时间: Tue Feb 15 11:22:06 2011
【问题】：已定序的intron loss event，可否仅是PCR时amplified到被转译的基因
片段，而非真正的lost intron
【问题起因】：小弟於研究中发现到几个intron loss events并且得到该intron完全
切除的定序结果，为之兴奋不已。但是有教授质疑此结果可能是我做
PCR时复制到刚好已完成转译的片段。
【个人看法】：由於整个DNA extraction过程中都有小心做RNase处理，理论上应该
不会发生转译完成的mRNA存在又被RT成cDNA後在PCR时增幅。另外；
跑胶的结果也都只有单一条cDNA size的band而已，如果是教授所说
的情况发生，应该会看到原本的基因片段和无intron的片段两条bands
同时存在。我用以上这两点解释时是蛮有信心的，可是教授一直在奸
笑，笑的我心发寒…
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.16.202
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◆ From: 140.116.16.202
1F：→ hal:多设计几组primer验证 比如跨intron或是跨exon的primer 02/15 13:07
2F：→ WinnieDad:我的primers本身就是依附exons而跨intron(s)的。 02/15 13:25