作者owl628 (owl628)
看板Biotech
標題[求救] 兩個胺基酸序列的比對
時間Wed Jan 12 23:53:18 2011
請問假如想要比對兩個物種中
A蛋白質的相似度similarity()以及相同度(identity)
請問有甚麼軟體可以幫我進行這樣的分析
我找了一些可以進行mutiple sequence alignment的軟體
都找不到有顯示相同度以及相似度(也可能是我不會設定@@)
不知道有沒有人可以分享可以簡單進行這樣分析的軟體
拜託了!!!!!,麻煩大家,謝謝~
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◆ From: 118.168.101.47
1F：推 mournermind:我知道NCBI的protein-protein blast可以 01/13 00:12
3F：→ mournermind:應該有些連結可以幫你~我覺得很多網頁比軟體好用耶! 01/13 00:14
4F：推 mzac1b:NCBI的序列比對應該就足夠 01/13 07:55
5F：→ mzac1b:多序列比對反而不易呈現你要的訊息 因為 你到底要比哪兩個 01/13 07:56
6F：→ mzac1b:所以就使用兩兩比對的模式 01/13 07:56
7F：→ f10582:跑一個蛋白質序列親源樹不就知道了? BioEdit/Mega都可以用 01/13 15:48
8F：→ mzac1b:可是他只有兩個物種 01/13 16:15
9F：→ mzac1b:只要多種比較 就不太可能呈現相似相同度之值 兩兩比才能啊 01/13 16:18
10F：推 Ianthegood:ncbi可以做phylogeny tree阿 叫cobalt吧找找看 01/13 22:08
11F：→ owl628:謝謝大家的意見^^ 01/14 17:56
12F：推 inchew:expasy上應該會有不少運算網站，可以去找找看。 01/14 19:07
13F：推 huhu126:Genedoc 01/15 22:41
14F：推 McRay:EMBOSS 01/22 10:53