作者owl628 (owl628)
看板Biotech
标题[求救] 两个胺基酸序列的比对
时间Wed Jan 12 23:53:18 2011
请问假如想要比对两个物种中
A蛋白质的相似度similarity()以及相同度(identity)
请问有甚麽软体可以帮我进行这样的分析
我找了一些可以进行mutiple sequence alignment的软体
都找不到有显示相同度以及相似度(也可能是我不会设定@@)
不知道有没有人可以分享可以简单进行这样分析的软体
拜托了!!!!!,麻烦大家,谢谢~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 118.168.101.47
1F：推 mournermind:我知道NCBI的protein-protein blast可以 01/13 00:12
3F：→ mournermind:应该有些连结可以帮你~我觉得很多网页比软体好用耶! 01/13 00:14
4F：推 mzac1b:NCBI的序列比对应该就足够 01/13 07:55
5F：→ mzac1b:多序列比对反而不易呈现你要的讯息 因为 你到底要比哪两个 01/13 07:56
6F：→ mzac1b:所以就使用两两比对的模式 01/13 07:56
7F：→ f10582:跑一个蛋白质序列亲源树不就知道了? BioEdit/Mega都可以用 01/13 15:48
8F：→ mzac1b:可是他只有两个物种 01/13 16:15
9F：→ mzac1b:只要多种比较 就不太可能呈现相似相同度之值 两两比才能啊 01/13 16:18
10F：推 Ianthegood:ncbi可以做phylogeny tree阿 叫cobalt吧找找看 01/13 22:08
11F：→ owl628:谢谢大家的意见^^ 01/14 17:56
12F：推 inchew:expasy上应该会有不少运算网站，可以去找找看。 01/14 19:07
13F：推 huhu126:Genedoc 01/15 22:41
14F：推 McRay:EMBOSS 01/22 10:53