作者jysw (Jennifer)
看板Biotech
標題[求救] 關於RNAi的機制問題
時間Thu Oct 21 20:55:51 2010
大家好
我遇到了一個關於RNAi機制的問題
我的target protein有兩個長度不同的isoforms
簡稱他們為A和B
B和A的序列基本上是一樣的
差別在於B在A的3端接近stop codon的地方插入了38個mer
使得B的stop codon延後出現 比A多出了四百多了mer
前陣子我發現我所使用的RNAi序列
幾乎都是target在這多出來的四百多個mer之中
我們的考量是此RNAi雖然也會認到A
但是經RNAi作用切除以後
A還是保有完整的序列從start到stop
一些書籍裡面只提到在RNAi做用完以後
不完整的RNA會接著被其他機制給分解掉
不知道大家有沒有遇過類似的狀況呢?
所以想問請問一下大家認為
我的RNAi是否會抑制到A表現呢?
先謝謝大家看完我這個冗長的解說了!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 118.169.33.63
1F：推 Ianthegood:是在3'UTR的意思嗎? 這個有意思了XD 10/22 05:54
2F：推 icome:會 3'UTR被摧毀polyA就沒了 translation和half life都會下降 10/22 12:06
3F：→ icome:事實上 作用在3'UTR的siRNA/shRNA經常使用在rescue的實驗中 10/22 12:07