作者jysw (Jennifer)
看板Biotech
标题[求救] 关於RNAi的机制问题
时间Thu Oct 21 20:55:51 2010
大家好
我遇到了一个关於RNAi机制的问题
我的target protein有两个长度不同的isoforms
简称他们为A和B
B和A的序列基本上是一样的
差别在於B在A的3端接近stop codon的地方插入了38个mer
使得B的stop codon延後出现 比A多出了四百多了mer
前阵子我发现我所使用的RNAi序列
几乎都是target在这多出来的四百多个mer之中
我们的考量是此RNAi虽然也会认到A
但是经RNAi作用切除以後
A还是保有完整的序列从start到stop
一些书籍里面只提到在RNAi做用完以後
不完整的RNA会接着被其他机制给分解掉
不知道大家有没有遇过类似的状况呢?
所以想问请问一下大家认为
我的RNAi是否会抑制到A表现呢?
先谢谢大家看完我这个冗长的解说了!
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◆ From: 118.169.33.63
1F：推 Ianthegood:是在3'UTR的意思吗? 这个有意思了XD 10/22 05:54
2F：推 icome:会 3'UTR被摧毁polyA就没了 translation和half life都会下降 10/22 12:06
3F：→ icome:事实上 作用在3'UTR的siRNA/shRNA经常使用在rescue的实验中 10/22 12:07