作者Menuet (無聊就是力量)
看板Biotech
標題[求救] 如何在cDNA中移除已經reverse transcript的tRNA和rRNA?
時間Wed Sep 22 02:08:51 2010
各位版友先進好
我最近在做環境的cDNA library，
但是抽完RNA以及反轉錄好所有的cDNA後(我是用random hexamers做cDNA)，
才發現這裡的cDNA可能還包括很多rRNA和tRNA，
可是如果要定序，
這樣會花太多錢在定rRNA和tRNA上，
而我的主要目標是mRNA。
然而查閱文獻資料後，
發現大部分的方法都是在轉成cDNA之前就已經清除了那些rRNA和tRNA了，
所以想請教一下，
有沒有什麼方法是可以在合成cDNA後再清除的?
感謝!
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◆ From: 142.157.130.197
1F：推 reinherd:我是家RNaes, 我用qiagen的cdna kit裡面有副 09/22 03:32
2F：推 williamyang:為何不再做一次用polyA primer轉cDNA就好,會比較快吧 09/22 10:14
3F：→ williamyang: T 09/22 15:11
4F：推 yaliu:或許原po是做細菌的？？ 09/22 16:01
5F：→ yaliu:嗯...不過細菌應該不是做cDNA啦～我耍笨了XD 09/22 16:02
6F：推 aggaci:1.用olido-dT作RT。2.若非得用radom primer作RT，那把RNA過 09/22 17:08
7F：→ aggaci:oligo-dT column純化mRNA 09/22 17:08
8F：→ Menuet:對我是target原核生物，所以沒有polyA..... 09/22 23:25
9F：→ Menuet:抱歉造成誤解，我應該用ssDNA來描述而不是用cDNA。 09/22 23:27