作者Menuet (无聊就是力量)
看板Biotech
标题[求救] 如何在cDNA中移除已经reverse transcript的tRNA和rRNA?
时间Wed Sep 22 02:08:51 2010
各位版友先进好
我最近在做环境的cDNA library，
但是抽完RNA以及反转录好所有的cDNA後(我是用random hexamers做cDNA)，
才发现这里的cDNA可能还包括很多rRNA和tRNA，
可是如果要定序，
这样会花太多钱在定rRNA和tRNA上，
而我的主要目标是mRNA。
然而查阅文献资料後，
发现大部分的方法都是在转成cDNA之前就已经清除了那些rRNA和tRNA了，
所以想请教一下，
有没有什麽方法是可以在合成cDNA後再清除的?
感谢!
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◆ From: 142.157.130.197
1F：推 reinherd:我是家RNaes, 我用qiagen的cdna kit里面有副 09/22 03:32
2F：推 williamyang:为何不再做一次用polyA primer转cDNA就好,会比较快吧 09/22 10:14
3F：→ williamyang: T 09/22 15:11
4F：推 yaliu:或许原po是做细菌的？？ 09/22 16:01
5F：→ yaliu:嗯...不过细菌应该不是做cDNA啦～我耍笨了XD 09/22 16:02
6F：推 aggaci:1.用olido-dT作RT。2.若非得用radom primer作RT，那把RNA过 09/22 17:08
7F：→ aggaci:oligo-dT column纯化mRNA 09/22 17:08
8F：→ Menuet:对我是target原核生物，所以没有polyA..... 09/22 23:25
9F：→ Menuet:抱歉造成误解，我应该用ssDNA来描述而不是用cDNA。 09/22 23:27