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※ 引述《honeytea96 ()》之銘言: : 小妹我目前在做關於cloning及biosensor相關的實驗 : 一開始做PCR 用proof reading Taq做了好幾次都鬼打牆 量非常少 : 後來老師可以用普通的Taq做 目前做出最好的情形大概是以下的照片 : http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4868394307/in/photostream/ 建議用2% gel跑,至少你的gene可以跟primer分開一點 : 三個sample都是P recA 基因 : 後來純化將三管混合作 PCR product的purification 圖大概是這樣(從右邊數來第二個) : (PCR純化我是用kit作 最後Elution solution的量是加12ul) ^^^^^^^^^ 你指的是clean up嗎? 這個步驟我建議你elution體積可以多一點 誠如版友所說的30-40ul,然後直接把它全部都拿去切 : http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4868396741/in/photostream/ : (不知道為什麼變比較淡~"~) : 後來繼續作到BamHI和XbaI的double digest 以下是digest program : [insert] [vector] : volume(uL) : buffer3 3 3 : BSA 3 3 ^^^ 你有稀釋?我通常就拿原液意思意思加1ul 感覺他的功用就是幫忙穩定enzyme之類的(?),濃度不用很在意 : insert 8 5 : BamHI 0.3 0.3 : XbaI 0.3 0.3 : dH2O 15.4 18.4 你可以做50ul,insert DNA就拿剛剛clean up後的DNA全部都下 enzyme不用這麼省,各1ul(因為我要確保它真的切乾淨,如果DNA量很多我還會再加) 其實這一步阿我會做到不補水,也就是說bf 5, BSA 1, enzyme各1, 所以clean up我會elute 45-50 ul....(elute完體積會少一點) 然後37度作用個4小時 vector的製備也是,你要確保它真的都能切得很乾淨 當然每經過一步純化,一定會lost掉很多DNA 所以一開始你就要有很多vector(反正就菌養多一點萃) insert是PCR來的,應該會有很多吧?? : 這是digest overnight 後的圖(抱歉已經切過膠) : http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4869015092/in/photostream/ 我覺得你這樣切有點危險耶,要不要跑2%,跑開一點 還有要記得限制酵素作用的那管全部都要下去gel extraction vector一樣切膠純化,當然啦不要浪費全都要拿去gel extraction vector部份用1% gel,一樣要跑開一點 另外,還有一個觀念要說 雖然gel上看不到,但不代表DNA不存在 如果確保每個步驟都沒問題,雖然電泳看不見,也是可以做ligation的 最後再小提醒一下,PCR產物直接切,記得primer切位要留幾個mer喔~~~ 以上,祝福你實驗順利! : 中間第二到第四個由左至右算起分別是 : vector.insert.100bp marker. 1kb marker : 經過切膠之後 用kit作purification 結果照出來就完全沒東西了Q_Q : http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4869017390/in/photostream/ : 已經經過了大概3次重複整個實驗過程 : 都是到最後沒辦法作到ligation的部份 : 雖然我覺得是後來digestion之後量變少 : 但真的事要量夠多到後來純化過colum跑膠才看的到嗎 : 希望各位大大能給一些意見喔 謝謝!!! --



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