作者yaliu (雅)
看板Biotech
标题Re: [求救] cloning实验做到digest gelpurificatio …
时间Tue Aug 10 00:03:41 2010
※ 引述《honeytea96 ()》之铭言:
: 小妹我目前在做关於cloning及biosensor相关的实验
: 一开始做PCR 用proof reading Taq做了好几次都鬼打墙 量非常少
: 後来老师可以用普通的Taq做 目前做出最好的情形大概是以下的照片
: http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4868394307/in/photostream/
建议用2% gel跑,至少你的gene可以跟primer分开一点
: 三个sample都是P recA 基因
: 後来纯化将三管混合作 PCR product的purification 图大概是这样(从右边数来第二个)
: (PCR纯化我是用kit作 最後Elution solution的量是加12ul)
^^^^^^^^^
你指的是clean up吗?
这个步骤我建议你elution体积可以多一点
诚如版友所说的30-40ul,然後直接把它全部都拿去切
: http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4868396741/in/photostream/
: (不知道为什麽变比较淡~"~)
: 後来继续作到BamHI和XbaI的double digest 以下是digest program
: [insert] [vector]
: volume(uL)
: buffer3 3 3
: BSA 3 3
^^^
你有稀释?我通常就拿原液意思意思加1ul
感觉他的功用就是帮忙稳定enzyme之类的(?),浓度不用很在意
: insert 8 5
: BamHI 0.3 0.3
: XbaI 0.3 0.3
: dH2O 15.4 18.4
你可以做50ul,insert DNA就拿刚刚clean up後的DNA全部都下
enzyme不用这麽省,各1ul(因为我要确保它真的切乾净,如果DNA量很多我还会再加)
其实这一步阿我会做到不补水,也就是说bf 5, BSA 1, enzyme各1,
所以clean up我会elute 45-50 ul....(elute完体积会少一点)
然後37度作用个4小时
vector的制备也是,你要确保它真的都能切得很乾净
当然每经过一步纯化,一定会lost掉很多DNA
所以一开始你就要有很多vector(反正就菌养多一点萃)
insert是PCR来的,应该会有很多吧??
: 这是digest overnight 後的图(抱歉已经切过胶)
: http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4869015092/in/photostream/
我觉得你这样切有点危险耶,要不要跑2%,跑开一点
还有要记得限制酵素作用的那管全部都要下去gel extraction
vector一样切胶纯化,当然啦不要浪费全都要拿去gel extraction
vector部份用1% gel,一样要跑开一点
另外,还有一个观念要说
虽然gel上看不到,但不代表DNA不存在
如果确保每个步骤都没问题,虽然电泳看不见,也是可以做ligation的
最後再小提醒一下,PCR产物直接切,记得primer切位要留几个mer喔~~~
以上,祝福你实验顺利!
: 中间第二到第四个由左至右算起分别是
: vector.insert.100bp marker. 1kb marker
: 经过切胶之後 用kit作purification 结果照出来就完全没东西了Q_Q
: http://www.flickr.com/photos/52798131@N04/4869017390/in/photostream/
: 已经经过了大概3次重复整个实验过程
: 都是到最後没办法作到ligation的部份
: 虽然我觉得是後来digestion之後量变少
: 但真的事要量够多到後来纯化过colum跑胶才看的到吗
: 希望各位大大能给一些意见喔 谢谢!!!
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