作者tsunamilin (...)
看板Biotech
標題[求救] 請問如何在一些序列中找到consensus sequence?
時間Mon May 24 12:14:43 2010
想請問我想在十個約30mer的序列中找到consensus sequence
例如
序列一 ： acggaggaccuuaug accca aacauuagac
序列二 ： cauugg accca gugguaggaaucugccuuc
如何在這兩個序列中找到accca是在這兩個序列中都有出現的序列？？
不知道有沒有生資的強者可以幫忙～～
謝謝謝謝！！
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 120.126.97.10
1F：→ hellheavn:ClastalW2 05/24 13:25
2F：推 jademan:bioedit可以 05/24 14:12
3F：→ tsunamilin:請問bioedite該如何操作呢？我只會clutalW Multiple 05/24 14:17
4F：→ tsunamilin:alignment 卻跑不出我想要的把accca排在一起 05/24 14:17
5F：推 DJHINN:上google 打 bioedit 就有一篇網誌專門講他了 !! 05/24 17:43
7F：→ DJHINN:雖然是很初淺的，但是 應該也夠用了 05/24 17:44
8F：→ tsunamilin:謝謝樓上提供的方法但是原本就用過這方法還是沒辦法跑 05/24 21:51
9F：→ tsunamilin:出accca的結果～ 05/24 21:51
10F：推 DJHINN:利用土法煉鋼 直接把序列複製 用搜尋去找吧~ 05/25 03:00
11F：→ DJHINN:找完之後 在自己推齊~ 05/25 03:00
12F：→ DJHINN:1. 先複製 accca 05/25 03:01
13F：→ DJHINN:2. 再到你要的序列旁 利用 ctrl+f 將序列貼上 他就會搜尋 05/25 03:02
14F：→ tsunamilin:恩...我貼的這兩個序列是例子～之後我所拿到的十個序列 05/25 11:07
15F：→ tsunamilin:中，有什麼保留性的序列是未知的，所以土法也沒辦法用 05/25 11:08
16F：→ tsunamilin:能夠請問一樓ClastalW2嗎？ 我只有搜尋到ClustalW2 05/25 11:09
17F：→ tsunamilin:但是還是不太會用 ^^" 05/25 11:09