作者tsunamilin (...)
看板Biotech
标题[求救] 请问如何在一些序列中找到consensus sequence?
时间Mon May 24 12:14:43 2010
想请问我想在十个约30mer的序列中找到consensus sequence
例如
序列一 ： acggaggaccuuaug accca aacauuagac
序列二 ： cauugg accca gugguaggaaucugccuuc
如何在这两个序列中找到accca是在这两个序列中都有出现的序列？？
不知道有没有生资的强者可以帮忙～～
谢谢谢谢！！
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 120.126.97.10
1F：→ hellheavn:ClastalW2 05/24 13:25
2F：推 jademan:bioedit可以 05/24 14:12
3F：→ tsunamilin:请问bioedite该如何操作呢？我只会clutalW Multiple 05/24 14:17
4F：→ tsunamilin:alignment 却跑不出我想要的把accca排在一起 05/24 14:17
5F：推 DJHINN:上google 打 bioedit 就有一篇网志专门讲他了 !! 05/24 17:43
7F：→ DJHINN:虽然是很初浅的，但是 应该也够用了 05/24 17:44
8F：→ tsunamilin:谢谢楼上提供的方法但是原本就用过这方法还是没办法跑 05/24 21:51
9F：→ tsunamilin:出accca的结果～ 05/24 21:51
10F：推 DJHINN:利用土法炼钢 直接把序列复制 用搜寻去找吧~ 05/25 03:00
11F：→ DJHINN:找完之後 在自己推齐~ 05/25 03:00
12F：→ DJHINN:1. 先复制 accca 05/25 03:01
13F：→ DJHINN:2. 再到你要的序列旁 利用 ctrl+f 将序列贴上 他就会搜寻 05/25 03:02
14F：→ tsunamilin:恩...我贴的这两个序列是例子～之後我所拿到的十个序列 05/25 11:07
15F：→ tsunamilin:中，有什麽保留性的序列是未知的，所以土法也没办法用 05/25 11:08
16F：→ tsunamilin:能够请问一楼ClastalW2吗？ 我只有搜寻到ClustalW2 05/25 11:09
17F：→ tsunamilin:但是还是不太会用 ^^" 05/25 11:09