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雖然我之前抽的都是動物的gDNA... 但我怎麼覺得你的步驟怪怪的?? 你的過程怎麼會做兩次沈降?(步驟6、12) 照我所知的原理跟抽動物的經驗 應該把步驟10. protease K跟3. extration buffer並在一起處理 煮65度 for 3hr (目的是破細胞跟切掉proteins) 之後做一到兩次phenol/choroform extraction (萃取並分離DNA跟其他物質) 再用100% EtOH + sodium acetate沈降 -20度 overnight或RT 30 min (溫度越低越久) 離心、75% EtOH清洗一次、烘乾就可用ddH2O或TE buffer回溶了 之前抽過一次植物的 似乎也沒分兩次沈降 雖然我沒做過抽蕈類...= =a 如果要參考其他protocol來做 我覺得參考plant的可能比較合適 不然看有沒有其他抽過蕈類的人分享作法摟~!! 以上一些建議 ※ 引述《ko363630 (打雜路人甲)》之銘言: : 老闆最近要我抽牛樟芝的gDNA : 我從自家的分生聖經以及學姐之前的做法下去做 : 雖然有很成功的抽出來 : 但是濃度卻是相當低,老闆說,可能是抽的時候DNA被切碎太多 : 但是我自己覺得不太可能,可能是牛樟芝用的量太少(取1g抽) : 這是我們的實驗步驟 : 1.濾紙抽氣過濾(無菌水清洗) : 2.液態氮研磨 : 3.每克菌絲加入4ml extration buffer : 4.add 4ml phenol/chloroform : 5.centrifuge(4oC、10000rpm、10min) : 6.add 1/10 3M Sodium acetate(pH5.2) and 100%EtoH to supernatant at -20oC for : 2hr : 7.centrifuge(10000rpm、10min) desupernatants in RT : 8.add 20mM Tris-HCL(pH:8.0) : 9.add 1ug RNase in 37oC 30min 150rpm : 10.add protease K (final concentration 150mg/ml) at 37oC for 60min : 11.add phenol volume mix, centrifuge(4oC 12000rpm 10min) : 12.add 1/10 3M Sodium acetate 3x voulme 100% EtoH (Final concentration 70%) : at -20oC 30min : 13.centrifuge(4oC 14000rpm 25min) : 14.add 10mM Tris-HCL(pH:8.0) : 這是我的實驗流程(第一次嘗試英文請不要care>"< 我才大二,英文還不好) : 老闆說,這次抽出來的片段碎掉很多。之前曾想過改用lysis buffer 來破菌。 : 自己上網找qaigen、promega 的protocol但是找到大部分都是關於blood、trusses、 : plant、yeast(同樣都是fungi,但是不知道能不能用) : 想請各位板上的大大不知道能不能提供一些經驗 : (要買kit的先不要好了= = 老闆聽到要花錢不知道會不會殺了我>"<) --



※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.94.205
1F:→ ko363630:我也不知道為什麼先前的人做兩次settle ~_~ 03/20 13:07
2F:→ ko363630:但是protease K 可以煮嗎= ="? sodium acetate(pH5.2) 03/20 13:08
3F:→ ko363630:放一陣子之後,不知道為什麼會跑到8.多 那時推測可能解 03/20 13:09
4F:→ ko363630:離了 因為弱酸鹽就是弱鹼(不忍思特) 是這樣嗎? 03/20 13:10
5F:→ Fourfish:protease K可以煮 只是我不確定是56度還65度...XD 03/20 17:30
6F:推 owl628:第二次是為了把RNase給去除,留下純的gDNA,我實驗室也會這樣 03/20 23:31







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