作者annelee (annelee)
看板Biotech
標題[求救] RNA isoform detect
時間Wed Dec 2 23:43:29 2009
不知道在這邊發問適不適合
這是一題作業
我現在有一個gene
在ensembl 上看到有許多個transcripts
也就是有不同的RNA isoform
要設計實驗來檢視這些isoform在各個不同組織的表現情形
因為他各個isoform有非常多一樣的序列
所以很難設計primer 跑PCR做check
想說改用設計probe來detect 各個isoform專一的片段
但是我之前只設計過primer (利用primer 3)
如果沒記錯的話primer 3應該也是可以設計probe的
可是 我不太懂那些參數要如何設定?
還有 我這樣的實驗設計是ok的嗎? 或是有更好的建議 更好的軟體建議使用?
非常謝謝!
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◆ From: 140.116.61.141
1F：推 qkenny:Check by the Northern blot. 12/03 21:23
2F：→ annelee:是要做northern blot 但不清楚probe該用哪些軟體參數設計 12/05 17:37