作者annelee (annelee)
看板Biotech
标题[求救] RNA isoform detect
时间Wed Dec 2 23:43:29 2009
不知道在这边发问适不适合
这是一题作业
我现在有一个gene
在ensembl 上看到有许多个transcripts
也就是有不同的RNA isoform
要设计实验来检视这些isoform在各个不同组织的表现情形
因为他各个isoform有非常多一样的序列
所以很难设计primer 跑PCR做check
想说改用设计probe来detect 各个isoform专一的片段
但是我之前只设计过primer (利用primer 3)
如果没记错的话primer 3应该也是可以设计probe的
可是 我不太懂那些参数要如何设定?
还有 我这样的实验设计是ok的吗? 或是有更好的建议 更好的软体建议使用?
非常谢谢!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.61.141
1F：推 qkenny:Check by the Northern blot. 12/03 21:23
2F：→ annelee:是要做northern blot 但不清楚probe该用哪些软体参数设计 12/05 17:37