作者cwpai (胖金魚)
看板Biotech
標題[求救] 如何比較兩個物種間的exon差異
時間Mon Nov 16 15:47:26 2009
基本上就是，我有兩個物種的A基因
而因為物種間差異，使得甲物種有34個exon而乙物種只有32個
因為想要將乙物種上某個相對於甲物種第28個的exon給去掉
但是又不肯定下手的目標exon也是28號
所以想知道各個exon間的對應
如果用 Ensembl 網站又該怎麼看？
他一改版我整個就暈......
（題外話，不知道是我這邊的網路問題還是怎樣，Ensembl實在超難連，我已經試了兩小時了
就是怎麼都連不上......）
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 163.13.116.191
1F：推 spermwarm:ㄟ~是我的話可能土法煉鋼 把sequence找到 blast看看 11/16 23:04
2F：→ spermwarm:不過 應該是有更快的方法啦~ 11/16 23:04
3F：推 fc01:把全序列丟给MEGA或BIOEDIT之類的演化分析軟體alignment 11/17 16:28
4F：→ fc01:然後自己慢慢看序列比對結果...天曉得兩個物種的同源基因 11/17 16:30
5F：→ fc01:exon真的會類似嘛,有可能發生兩個exon=另一物種1個exon之類 11/17 16:31
6F：→ mzac1b:只比兩個物種好像看不出什麼? 11/17 19:29
7F：→ mzac1b:應該比較一系列物種的exon 吧 11/17 19:29
8F：→ mzac1b:不同物種之 exon數目 DNA序列 蛋白質序列 motif 11/17 19:30
9F：→ mzac1b:依其種屬關係ㄧ並比較 衍伸的話連同系列基因通通整理找關聯 11/17 19:31
10F：→ mzac1b:如果只看兩物種 之 exon 似乎看不出什麼 11/17 19:31