作者cwpai (胖金鱼)
看板Biotech
标题[求救] 如何比较两个物种间的exon差异
时间Mon Nov 16 15:47:26 2009
基本上就是，我有两个物种的A基因
而因为物种间差异，使得甲物种有34个exon而乙物种只有32个
因为想要将乙物种上某个相对於甲物种第28个的exon给去掉
但是又不肯定下手的目标exon也是28号
所以想知道各个exon间的对应
如果用 Ensembl 网站又该怎麽看？
他一改版我整个就晕......
（题外话，不知道是我这边的网路问题还是怎样，Ensembl实在超难连，我已经试了两小时了
就是怎麽都连不上......）
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 163.13.116.191
1F：推 spermwarm:ㄟ~是我的话可能土法炼钢 把sequence找到 blast看看 11/16 23:04
2F：→ spermwarm:不过 应该是有更快的方法啦~ 11/16 23:04
3F：推 fc01:把全序列丢给MEGA或BIOEDIT之类的演化分析软体alignment 11/17 16:28
4F：→ fc01:然後自己慢慢看序列比对结果...天晓得两个物种的同源基因 11/17 16:30
5F：→ fc01:exon真的会类似嘛,有可能发生两个exon=另一物种1个exon之类 11/17 16:31
6F：→ mzac1b:只比两个物种好像看不出什麽? 11/17 19:29
7F：→ mzac1b:应该比较一系列物种的exon 吧 11/17 19:29
8F：→ mzac1b:不同物种之 exon数目 DNA序列 蛋白质序列 motif 11/17 19:30
9F：→ mzac1b:依其种属关系ㄧ并比较 衍伸的话连同系列基因通通整理找关联 11/17 19:31
10F：→ mzac1b:如果只看两物种 之 exon 似乎看不出什麽 11/17 19:31