作者Fourfish (~四條魚~)
看板Biotech
標題Re: [討論] His-tag protein 純化問題
時間Fri Sep 4 23:58:59 2009
請教幾個問題:
1.你的sample黏不黏(稠)? 黏的話請加點DNaseI試試看
2.你產生的protein多不多?濃不濃?
我前陣子的經驗是lysate中protein太多
一進column就沈澱了 結果就塞管....
因為你有濃縮的步驟 所以建議不要把protein濃縮的太濃 不然protein容易沈澱出來
3.純化過程所有buffer的pH是否正確、一致?
記得要考慮一下protein的pI 不然容易在純化時沈澱
4.你在準備(或清洗)column時,將resin沖散後會不會看到resin慢慢聚成數個小團塊?
或很多resin會黏附在column壁上?
有的話,請一定要做clean up,或許你收的medium中有很多lipid,讓resin容易成團不散
5.你指的"只用三次"是指全新的resin剛用三次?還是舊resin重新packing用三次?
如果是舊的,那請clean up。
Clean up的方法不外乎有溫和型:20% EtOH、70% EtOH、1.5M NaCl
暴力型:0.1-0.5% detergent、1M NaOH、8M Urea、6M Gua-HCl等
和你分享一下我上次的超暴力clean up的protocol:
(因為塞管lose超多protein所以不爽...)
我是用重力法 沒用pump 只是開關全開 流速最大 加pipeting沖散resin
a. 0.5M NaCl, 50mM EDTA, pH~7.0 column灌滿 (~50mL的colum, resin~2-3mL)
b. ddH2O 灌滿兩次以上
c. 0.5M NaCl, 8M Urea, pH~7.0 至少5V 沖散靜置約5-10min
d. ddH2O 灌滿兩次以上
e. 0.5M NaCl, 0.5% Triton X-100, pH~7.0 灌滿兩次以上
(以上步驟部分我有含20mM Tris 你也可以用自己的buffer或PBS)
f. ddH2O 灌滿兩次
g. 1M NaOH 灌滿 沖散後浸泡1hr
h. ddH2O 灌滿兩次以上
i. 20% EtOH 灌滿一次
j. ddH2O 灌滿兩次以上
k. Recharge Ni、重新置換buffer平衡~ 跟新的差不多好用~
以上 給你參考 希望對你有幫助...
ps.請注意~這樣clean up超暴力 效果不錯但resin也很容易掛...
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.94.205
1F:推 biogene:pI和pH是怎麼影響呀? 09/05 00:01
2F:→ Fourfish:protein的電性啊 09/05 00:22
3F:→ biogene:那是elution buffer跟pI太接近的話不太好嗎? 09/05 00:36
4F:→ Fourfish:好或不好可能要視何種蛋白 我們家是會遠離pI 0.5-1以上 09/05 00:42
5F:推 wensing:相當爆力! 09/05 01:00
6F:推 wensing:我的是直接混合 50mM NaH2PO4 20mM EDTA 7M urea 09/05 01:05
7F:→ wensing:1%(w/v) SDS, pH = 4.0 然後直接將resin懸浮與填滿column 09/05 01:06
8F:→ wensing:重覆2~3次。 最後,再用大量ddH2O清洗兩次以上, 09/05 01:09
9F:→ wensing:然後,用20%酒精保存,等到下次要用時,再recharge Ni+2 09/05 01:10
10F:→ wensing:與buffer平衡。 09/05 01:11
11F:推 wensing:另外,我所有使用的液體,都一定會費工夫地去過0.22um。 09/05 01:14
12F:→ wensing:有時候,是配出來的溶液 太髒,存在一些小小小顆粒 09/05 01:16
13F:→ wensing:塞住column,導致過不去 09/05 01:17
14F:推 wensing:對了,那clean buffer我還有加入10mM β-ME 09/05 01:41