作者littlelizard (專注)
站內Biotech
標題Re: [求救] 西方墨點測試蛋白的合成
時間Fri Jul 3 01:49:55 2009
原文恕刪
1F：推 littlelizard:會轉錄和轉譯後修飾是兩回事吧? 假設說這是個醣蛋白 06/30 16:44
2F：→ littlelizard:你用E.coli表現他的folding就不對了 之後真菌表現的 06/30 16:44
3F：→ littlelizard:有醣基化的話 可能就把你原本會辨識的epitope蓋住了 06/30 16:45
4F：推 littlelizard:拿你的胺基酸序列去預測一下epitope和轉譯後修飾位置 06/30 16:49
5F：→ bbiioo:..恩~了解 那再問一下..要預測 可以去哪測?(網站) 07/01 00:24
6F：→ bbiioo:還是說 我手上有DNA Star這套軟體 他可以作這預測嗎?謝謝 07/01 00:24
我想有點長還是回一下
DNA Star這套軟體裡的Protein可以預測
另外有些線上網站也可以預測epitope
1.Prediction Antigenic Peptides (Web)：
Harvard CVC Bioinformatics Tools – Predicting Antigenic Peptides
http://bio.dfci.harvard.edu/Tools/antigenic.pl
IEDB Analysis Resource
http://tools.immuneepitope.org/tools/bcell/iedb_input
選擇Kolaskar & Tongaonkar Antigenicity (1990)或Bepipred Linear Epitope
Prediction (2006) 方法。
2.Signal Peptides (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
3.Phosphorylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/
4.N-Glycosylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/
5.O-Glycosylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/
6.protein blast (Web)：
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
這是要看你的抗原和免疫動物的親緣相似性
太相近免疫效果不好
--
以上是修 單株抗體 課程的一些資料
有錯請更正
謝謝
--
他 打 ㄋㄐ ∥你 被 卡卡獸 ∥幹 開 我 柏油 ∥我 打 瓦哥
每 我 ◢ ◣ ∥看 打 〒 〒 ∥你 心 的 ◢█ ◣∥的 腫█◥◥◥◤
天 。 ★▃ ★▃ ∥我 斷 ▼▼ ▼ ∥媽 就 瓦 ◤ ∥尾 。█≧ ≦ 好▄︴
回 ～●──●～ ∥牙 了 ▲ ▲ ） ∥的 點 斯 ─⊙-⊙- ∥巴 ◤ ＞ 腫▄
來 ◥ ◤∥齒 。 / ∥他 火 ！ 皿 ∥都 ◥ △◤︴▄好
都 ∥都 ││ ∥不 燒 ◥ ︶◤ ∥被 ◥ ◤ ▄腫
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 61.224.24.90
7F：推 afunafun:推 整理很詳細 至於預測signal peptide的 還有很多種 07/03 04:23
8F：→ afunafun:等哪天有空再來幫補上 07/03 04:24