作者littlelizard (专注)
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标题Re: [求救] 西方墨点测试蛋白的合成
时间Fri Jul 3 01:49:55 2009
原文恕删
1F：推 littlelizard:会转录和转译後修饰是两回事吧? 假设说这是个醣蛋白 06/30 16:44
2F：→ littlelizard:你用E.coli表现他的folding就不对了 之後真菌表现的 06/30 16:44
3F：→ littlelizard:有醣基化的话 可能就把你原本会辨识的epitope盖住了 06/30 16:45
4F：推 littlelizard:拿你的胺基酸序列去预测一下epitope和转译後修饰位置 06/30 16:49
5F：→ bbiioo:..恩~了解 那再问一下..要预测 可以去哪测?(网站) 07/01 00:24
6F：→ bbiioo:还是说 我手上有DNA Star这套软体 他可以作这预测吗?谢谢 07/01 00:24
我想有点长还是回一下
DNA Star这套软体里的Protein可以预测
另外有些线上网站也可以预测epitope
1.Prediction Antigenic Peptides (Web)：
Harvard CVC Bioinformatics Tools – Predicting Antigenic Peptides
http://bio.dfci.harvard.edu/Tools/antigenic.pl
IEDB Analysis Resource
http://tools.immuneepitope.org/tools/bcell/iedb_input
选择Kolaskar & Tongaonkar Antigenicity (1990)或Bepipred Linear Epitope
Prediction (2006) 方法。
2.Signal Peptides (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
3.Phosphorylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/
4.N-Glycosylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/
5.O-Glycosylation sites (Web)：
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/
6.protein blast (Web)：
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
这是要看你的抗原和免疫动物的亲缘相似性
太相近免疫效果不好
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以上是修 单株抗体 课程的一些资料
有错请更正
谢谢
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他 打 ㄋㄐ ∥你 被 卡卡兽 ∥干 开 我 柏油 ∥我 打 瓦哥
每 我 ◢ ◣ ∥看 打 〒 〒 ∥你 心 的 ◢█ ◣∥的 肿█◥◥◥◤
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来 ◥ ◤∥齿 。 / ∥他 火 ！ 皿 ∥都 ◥ △◤︴▄好
都 ∥都 ││ ∥不 烧 ◥ ︶◤ ∥被 ◥ ◤ ▄肿
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◆ From: 61.224.24.90
7F：推 afunafun:推 整理很详细 至於预测signal peptide的 还有很多种 07/03 04:23
8F：→ afunafun:等哪天有空再来帮补上 07/03 04:24