作者chvkimo (達)
看板Biotech
標題Re: [求救] calc. cancer cell methods
時間Sun Jan 11 00:36:00 2009
※ 引述《ararthur ()》之銘言：
: 大家新年安好，
: 在新年看paper的時候看到一段文字，
: ~colonyforming assay is much more sensitive than the dye exclusion assay
: to detect PM cytotoxicity.
: (for cancer cell)
: 請問，
: 為什麼colonyforming assay會比較sensitive呢?
: 謝謝解答。
提出個人的見解來解釋,只有瀏覽一下這篇paper
若有錯誤,歡迎指教指正,謝謝
參考paper
http://tinyurl.com/9mv43b (google搜到的,不知道是不是這篇)
-----------------------分 隔 線---------------------------------------
colonyforming assay中,細胞形成colony過程中需要完整的cell cycle
而且是一而再,再而三地完成cell cycle.
在實驗結果中,如果colony過小的話並不能被計為一個colony.
回到dye exclusion assay及colonyforming assay的比較,
此篇paper中,當細胞被處理藥物之後,
由dye exclusion所認定的活細胞可能是不健康的.
如果給予一段時間分裂生長後,也許這細胞並不能分裂成一個夠大的colony
所以colonyforming assay對活細胞的認定條件更嚴格
因此才會說
colonyforming assay is much more sensitive than dye exclusion assay
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 219.68.56.247
※ 編輯: chvkimo 來自: 219.68.56.247 (01/11 00:40)
1F：推 blence:dye exclusion應該要做到跟CFA一樣放十天在數結果才合理,否 01/11 01:22
2F：→ blence:則在不相同的條件要比較那個技術sensitive根本不合理,句子 01/11 01:24
3F：→ blence:本來就不是"證明"差異,而是"觀察"慣用技術下"對PM"有利選擇 01/11 01:29
4F：推 ararthur:那這樣應該是增加specificity而不算是sensitive吧 01/11 02:32
5F：推 ararthur:如果增加specificity的話 通常會減少sensitivity吧?! 01/11 02:34
6F：→ ararthur:唔 另外一樓說放十天再數 應該不可能吧? 01/11 02:42
7F：→ ararthur:或者我改成問 為什麼cfa會比dea對PM treat的觀察更有利呢 01/11 02:43
8F：→ ararthur:想到的都只有cfa的specificity高的原因 找不到正確的解釋 01/11 02:44
9F：→ ararthur:不過謝謝大家的討論:) 01/11 02:45
10F：→ chvkimo:回一樓blence大~我認為這兩種方法上就是因為時間點的不同 01/11 11:27
11F：→ chvkimo:才造成結果的不同,我可以說我是在處理完藥物後同時進行這 01/11 11:30
12F：→ chvkimo:兩種測試,然後比較 01/11 11:30
13F：→ chvkimo:但是你的說法或許有個盲點,如果我將細胞處理後再放10天 01/11 11:41
14F：→ chvkimo:再做dye exclusion,那麼只要有存活的細胞就可以分裂成很多 01/11 11:42
15F：→ chvkimo:細胞,那麼算出來的細胞存活率應該會趨近100%,因為這種作法 01/11 11:43
16F：→ chvkimo:就會被活細胞數給屏蔽了 01/11 11:46
17F：推 ararthur:那讓我們重回問題本身 是怎麼樣的情形在這10天長成colony 01/11 12:28
18F：→ ararthur:過程中 讓cfa比dea更sensitive了呢? 01/11 12:31
19F：推 ararthur:原因是cfa在挑選活細胞的條件更嚴苛 所以估計到的細胞數 01/11 12:36
20F：→ ararthur:才會比較少這樣子講對嗎?唔 看來是有點邏輯的問題 謝謝^^ 01/11 12:38
21F：推 blence:To c,你不會放控制組嗎?細胞也會稀釋吧？CFA允許細胞可以在 01/11 13:59
22F：→ blence:新鮮培養液存活十天,又事先稀釋種細胞數,DEA有何不可? 01/11 14:01
23F：→ blence:而且也些人CFA不用數,在同樣操作條件將十天後群落整個打散 01/11 14:03
24F：→ blence:再用DEA評估稀釋後的細胞數,這兩個過程本來就可以相互採用 01/11 14:07
25F：→ chvkimo:我跟blence大討論過後,b大是認為此篇是只有侷限在此篇的條 01/11 16:44
26F：→ chvkimo:件下所做的結論 01/11 16:45
27F：→ chvkimo:而非所有對象都是如此 謝謝 01/11 16:46