作者chvkimo (达)
看板Biotech
标题Re: [求救] calc. cancer cell methods
时间Sun Jan 11 00:36:00 2009
※ 引述《ararthur ()》之铭言：
: 大家新年安好，
: 在新年看paper的时候看到一段文字，
: ~colonyforming assay is much more sensitive than the dye exclusion assay
: to detect PM cytotoxicity.
: (for cancer cell)
: 请问，
: 为什麽colonyforming assay会比较sensitive呢?
: 谢谢解答。
提出个人的见解来解释,只有浏览一下这篇paper
若有错误,欢迎指教指正,谢谢
参考paper
http://tinyurl.com/9mv43b (google搜到的,不知道是不是这篇)
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colonyforming assay中,细胞形成colony过程中需要完整的cell cycle
而且是一而再,再而三地完成cell cycle.
在实验结果中,如果colony过小的话并不能被计为一个colony.
回到dye exclusion assay及colonyforming assay的比较,
此篇paper中,当细胞被处理药物之後,
由dye exclusion所认定的活细胞可能是不健康的.
如果给予一段时间分裂生长後,也许这细胞并不能分裂成一个够大的colony
所以colonyforming assay对活细胞的认定条件更严格
因此才会说
colonyforming assay is much more sensitive than dye exclusion assay
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 219.68.56.247
※ 编辑: chvkimo 来自: 219.68.56.247 (01/11 00:40)
1F：推 blence:dye exclusion应该要做到跟CFA一样放十天在数结果才合理,否 01/11 01:22
2F：→ blence:则在不相同的条件要比较那个技术sensitive根本不合理,句子 01/11 01:24
3F：→ blence:本来就不是"证明"差异,而是"观察"惯用技术下"对PM"有利选择 01/11 01:29
4F：推 ararthur:那这样应该是增加specificity而不算是sensitive吧 01/11 02:32
5F：推 ararthur:如果增加specificity的话 通常会减少sensitivity吧?! 01/11 02:34
6F：→ ararthur:唔 另外一楼说放十天再数 应该不可能吧? 01/11 02:42
7F：→ ararthur:或者我改成问 为什麽cfa会比dea对PM treat的观察更有利呢 01/11 02:43
8F：→ ararthur:想到的都只有cfa的specificity高的原因 找不到正确的解释 01/11 02:44
9F：→ ararthur:不过谢谢大家的讨论:) 01/11 02:45
10F：→ chvkimo:回一楼blence大~我认为这两种方法上就是因为时间点的不同 01/11 11:27
11F：→ chvkimo:才造成结果的不同,我可以说我是在处理完药物後同时进行这 01/11 11:30
12F：→ chvkimo:两种测试,然後比较 01/11 11:30
13F：→ chvkimo:但是你的说法或许有个盲点,如果我将细胞处理後再放10天 01/11 11:41
14F：→ chvkimo:再做dye exclusion,那麽只要有存活的细胞就可以分裂成很多 01/11 11:42
15F：→ chvkimo:细胞,那麽算出来的细胞存活率应该会趋近100%,因为这种作法 01/11 11:43
16F：→ chvkimo:就会被活细胞数给屏蔽了 01/11 11:46
17F：推 ararthur:那让我们重回问题本身 是怎麽样的情形在这10天长成colony 01/11 12:28
18F：→ ararthur:过程中 让cfa比dea更sensitive了呢? 01/11 12:31
19F：推 ararthur:原因是cfa在挑选活细胞的条件更严苛 所以估计到的细胞数 01/11 12:36
20F：→ ararthur:才会比较少这样子讲对吗?唔 看来是有点逻辑的问题 谢谢^^ 01/11 12:38
21F：推 blence:To c,你不会放控制组吗?细胞也会稀释吧？CFA允许细胞可以在 01/11 13:59
22F：→ blence:新鲜培养液存活十天,又事先稀释种细胞数,DEA有何不可? 01/11 14:01
23F：→ blence:而且也些人CFA不用数,在同样操作条件将十天後群落整个打散 01/11 14:03
24F：→ blence:再用DEA评估稀释後的细胞数,这两个过程本来就可以相互采用 01/11 14:07
25F：→ chvkimo:我跟blence大讨论过後,b大是认为此篇是只有局限在此篇的条 01/11 16:44
26F：→ chvkimo:件下所做的结论 01/11 16:45
27F：→ chvkimo:而非所有对象都是如此 谢谢 01/11 16:46